RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 MYO1HQ8N1T3 1032 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 CSNK1A1LQ8N752 337 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 GPATCH11Q8N954 259 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 FDCSPQ8NFU4 85 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 MCOLN3Q8TDD5 553 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 IFT81Q8WYA0 676 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 VPS39Q96JC1 886 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 CABS1Q96KC9 395 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 C10orf90Q96M02 699 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 SPSB2Q99619 263 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 NUDT9Q9BW91 350 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 SYNPO2LQ9H987 977 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 PARVBQ9HBI1 364 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF304Q9HCX3 659 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 P4HTMQ9NXG6 502 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 GPR83Q9NYM4 423 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
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SGMS1-201ENST00000361543 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 MAU2Q9Y6X3 613 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 SHANK1Q9Y566 2161 aa7.3□□□□□ -1.24
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SGMS1-201ENST00000361543 SLC12A2P55011 1212 aa7.3□□□□□ -1.24
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SGMS1-201ENST00000361543 PRMT9Q6P2P2 845 aa7.3□□□□□ -1.24
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SGMS1-201ENST00000361543 CCDC138Q96M89 665 aa7.3□□□□□ -1.24
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SGMS1-201ENST00000361543 OLFM1Q99784 485 aa7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 CPNE1Q99829 537 aa7.3□□□□□ -1.24
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SGMS1-201ENST00000361543 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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SGMS1-201ENST00000361543 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 FBXL4Q9UKA2 621 aa7.3□□□□□ -1.24
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SGMS1-201ENST00000361543 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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SGMS1-201ENST00000361543 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa7.3□□□□□ -1.24
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SGMS1-201ENST00000361543 H7BY64 318 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 MASP2O00187 686 aa7.29□□□□□ -1.24
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SGMS1-201ENST00000361543 ALPPP05187 535 aa7.29□□□□□ -1.24
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SGMS1-201ENST00000361543 ZGLP1P0C6A0 271 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 HIST1H2ADP20671 130 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 SAT1P21673 171 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 CCND1P24385 295 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 HRH2P25021 359 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 TNFRSF8P28908 595 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 SPRP35270 261 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 PGGT1BP53609 377 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 MLLT10P55197 1068 aa7.29□□□□□ -1.24
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