RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL38P63173 70 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ACSM2AQ08AH3 577 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.851e-6■■■■□ 22.3
RABGGTB-201ENST00000319942 CLCA4Q14CN2 919 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 RPE65Q16518 533 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 C1orf146Q5VVC0 180 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM219BQ5XKK7 198 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ACSM2BQ68CK6 577 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PRMT9Q6P2P2 845 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PGM2L1Q6PCE3 622 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 GCNT7Q6ZNI0 430 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 TMPRSS11BQ86T26 416 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 LAS2Q8IYD9 372 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 CADM4Q8NFZ8 388 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 OR7G3Q8NG95 312 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 OR9I1Q8NGQ6 314 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 HMGCLL1Q8TB92 370 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR20Q8TBZ3 569 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PROKR1Q8TCW9 393 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFPM2Q8WW38 1151 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 SNX19Q92543 992 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 STMN2Q93045 179 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 KLHDC7BQ96G42 594 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 DPY30Q9C005 99 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXQ1Q9C009 403 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 TBC1D17Q9HA65 648 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 EBF2Q9HAK2 575 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 MAPRE3Q9UPY8 281 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 SIT1Q9Y3P8 196 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa9.75□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 OR5K4A6NMS3 321 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 METTL12A8MUP2 240 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 C10orf142B7Z368 130 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP6V1G2O95670 118 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 IL6P05231 212 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXO45P0C2W1 286 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 THEGLP0DJG4 465 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ERGP11308 486 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 CD1EP15812 388 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 JAK1P23458 1154 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 CD27P26842 260 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ACTR1BP42025 376 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PIK3CBP42338 1070 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 CCR8P51685 355 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ACTR1AP61163 376 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 RCAN2Q14206 197 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 CATSPEREQ5SY80 951 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 REP15Q6BDI9 236 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 LIX1Q8N485 282 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 OR13H1Q8NG92 308 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2L8Q8NGY9 312 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 RLN3Q8WXF3 142 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 CXorf40BQ96DE9 158 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 IL17FQ96PD4 163 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 AIF1LQ9BQI0 150 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ACAT2Q9BWD1 397 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 GSDMCQ9BYG8 508 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM168Q9H0V1 697 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 CHRDQ9H2X0 955 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 DCLRE1BQ9H816 532 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PELI2Q9HAT8 420 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 AHSPQ9NZD4 102 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ADA2Q9NZK5 511 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC7A8Q9UHI5 535 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PLAGL1Q9UM63 463 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGEB17A8MXT2 336 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 FBP2O00757 339 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 STAMBPO95630 424 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 BCKDHAP12694 445 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 CDH1P12830 882 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 CTSEP14091 401 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 AMD1P17707 334 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 CD22P20273 847 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ME2P23368 584 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 HRH2P25021 359 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 SERPINB1P30740 379 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 MTTPP55157 894 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 CLDN8P56748 225 aa9.73□□□□□ -0.85
RABGGTB-201ENST00000319942 ACTR3P61158 418 aa9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms