RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLHL20Q9Y2M5 609 aa26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 U3KQA8 63 aa26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCM1Q15154 2024 aa26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa26.35■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 B4GAT1O43505 415 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 VPS4BO75351 444 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDYNP01213 254 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 NEK2P51955 445 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 FIGLAQ6QHK4 219 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLXDC1Q8IUK5 500 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 LAS2Q8IYD9 372 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 USP7Q93009 1102 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 TGM7Q96PF1 710 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 EBF4Q9BQW3 602 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB33BQ9H082 229 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 NT5DC2Q9H857 520 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 EPHA6Q9UF33 1036 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRBC2A0A5B9 178 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 GOLGA8OA6NCC3 632 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKDD1BA6NHY2 528 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 GOLGA8NF8WBI6 632 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 RGS14O43566 566 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR1F1O43749 312 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAGP20916 626 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 EPHA3P29320 983 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP1CAP62136 330 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF165Q6ZSG1 346 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF740Q8NDX6 193 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 IFI44Q8TCB0 444 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 HBEGFQ99075 208 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD180Q99467 661 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPNS1Q9H2V7 528 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 SEMA6CQ9H3T2 930 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCF7L2Q9NQB0 619 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 FTSJ1Q9UET6 329 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADGRE2Q9UHX3 823 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 CUL9Q8IWT3 2517 aa26.34■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNAH14Q0VDD8 3507 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 SDHDO14521 159 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNFSF14O43557 240 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 SERPINB1P30740 379 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF425Q6IV72 752 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 TTLQ8NG68 377 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR20Q8TBZ3 569 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 TUBGCP3Q96CW5 907 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC3Q9BQI4 270 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1GALT1Q9NS00 363 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 FEZF1A0PJY2 475 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP6AP2O75787 350 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 EZRP15311 586 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 PERM1Q5SV97 790 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM92BQ6ZTR7 304 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIM46Q7Z4K8 759 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 PAQR7Q86WK9 346 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 CEP70Q8NHQ1 597 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 HUS1BQ8NHY5 278 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 STON2Q8WXE9 905 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC28BQ9BUN5 200 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLHL25Q9H0H3 589 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 HAT1O14929 419 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAP3K7O43318 606 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSD3B1P14060 373 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 PVRP15151 417 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 CKMT2P17540 419 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSD3B2P26439 372 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD1CP29017 333 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIK3CBP42338 1070 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 USP53Q70EK8 1073 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLD3Q8IV08 490 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACTRT2Q8TDY3 377 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 C3orf30Q96M34 536 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPM1MQ96MI6 270 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 PARD6AQ9NPB6 346 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 RXFP3Q9NSD7 469 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLK4Q9Y5K2 254 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2A25A4D2G3 310 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 TLCD2A6NGC4 264 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 RASSF9O75901 435 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 LSSP48449 732 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 NR6A1Q15406 480 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 XKR7Q5GH72 579 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 NAXDQ8IW45 347 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP26.3■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms