RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282344.10

USP12-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP12, Length 4,511 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12-201ENST00000282344 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa21.1■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 IDSP22304 550 aa21.1■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 ERVPABLB-1P60509 514 aa21.1■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 RPS13P62277 151 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa21.1■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 TICAM1Q8IUC6 712 aa21.1■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 KREMEN2Q8NCW0 462 aa21.1■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa21.1■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 KCNH6Q9H252 994 aa21.1■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 COCHO43405 550 aa21.09■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 HCN1O60741 890 aa21.09■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 PRR5P85299 388 aa21.09■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 SPIN4Q56A73 249 aa21.09■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 OR8H1Q8NGG4 311 aa21.09■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 KLHL6Q8WZ60 621 aa21.09■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 PCTPQ9UKL6 214 aa21.09■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 PITPNM1O00562 1244 aa21.09■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 HTR1BP28222 390 aa21.09■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 TUBA1BP68363 451 aa21.09■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 VMACQ2NL98 169 aa21.09■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 GTDC1Q4AE62 458 aa21.09■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 TUBA1AQ71U36 451 aa21.09■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 BIRC8Q96P09 236 aa21.09■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 TBCCD1Q9NVR7 557 aa21.09■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 B4GAT1O43505 415 aa21.09■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 IFNGP01579 166 aa21.09■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 PSKH1P11801 424 aa21.09■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 LGALS3BPQ08380 585 aa21.09■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 DEFB115Q30KQ5 88 aa21.09■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 UFD1Q92890 307 aa21.09■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 ZFP3Q96NJ6 502 aa21.09■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 TBX5Q99593 518 aa21.09■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 ARMC1Q9NVT9 282 aa21.09■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa21.08■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 ZNF623O75123 536 aa21.08■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 AVPR1BP47901 424 aa21.08■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 DGKGP49619 791 aa21.08■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 RPP38P78345 283 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 RING1Q06587 406 aa21.08■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 E2F2Q14209 437 aa21.08■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP21.08■□□□□ 0.971e-6■■■■■ 34.3
USP12-201ENST00000282344 ATG9BQ674R7 924 aa21.08■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 OR10H4Q8NGA5 316 aa21.08■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 LGALS12Q96DT0 336 aa21.08■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 MED28Q9H204 178 aa21.08■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 TJP1Q07157 1748 aa21.08■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 C6orf47O95873 294 aa21.08■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 PDYNP01213 254 aa21.08■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 H1F0P07305 194 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 ARSAP15289 507 aa21.08■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 SUSD1Q6UWL2 747 aa21.08■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 DTWD1Q8N5C7 304 aa21.08■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 GOLM1Q8NBJ4 401 aa21.08■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa21.08■□□□□ 0.97
USP12-201ENST00000282344 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 NT5EP21589 574 aa21.08■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 LRP8Q14114 963 aa21.08■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 PON2Q15165 354 aa21.08■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 FBXO43Q4G163 708 aa21.08■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 KANK2Q63ZY3 851 aa21.08■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 AMZ2Q86W34 360 aa21.08■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 MEIOBQ8N635 442 aa21.08■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 TTC9BQ8N6N2 239 aa21.08■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 SCAIQ8N9R8 606 aa21.08■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 ALPK1Q96QP1 1244 aa21.08■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 TUBA1CQ9BQE3 449 aa21.08■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 TMEM181Q9P2C4 612 aa21.08■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 SPO11Q9Y5K1 396 aa21.08■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 CBSLP0DN79 551 aa21.08■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 CBSP35520 551 aa21.08■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 CRISP3P54108 245 aa21.08■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 PKDCCQ504Y2 493 aa21.08■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 TPGS2Q68CL5 300 aa21.08■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 ZNF461Q8TAF7 563 aa21.08■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 KLK6Q92876 244 aa21.08■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 CHRNA1P02708 482 aa21.07■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 CD47Q08722 323 aa21.07■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 ST3GAL4Q11206 333 aa21.07■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 CADM2Q8N3J6 435 aa21.07■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 ZNF597Q96LX8 424 aa21.07■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 STATHP02808 62 aa21.07■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 SCD5Q86SK9 330 aa21.07■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 SERINC5Q86VE9 423 aa21.07■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 TRPV1Q8NER1 839 aa21.07■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa21.07■□□□□ 0.96
USP12-201ENST00000282344 SPACA7Q96KW9 195 aa21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms