RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 NEIL2Q969S2 332 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 FKBP10Q96AY3 582 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 NTMT1Q9BV86 223 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 RAD21L1Q9H4I0 556 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 GORASP2Q9H8Y8 452 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 RAD18Q9NS91 495 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 FZD4Q9ULV1 537 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 SNX11Q9Y5W9 270 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 SNX8Q9Y5X2 465 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 SNX5Q9Y5X3 404 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 MYO10Q9HD67 2058 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 FRYLO94915 3013 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 PRR23AA6NEV1 266 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 TRIM64CA6NLI5 447 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 FAM20BO75063 409 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 NDUFS2O75306 463 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 TULP3O75386 442 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 SEC14L2O76054 403 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 NADKO95544 446 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 LRG1P02750 347 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 ALPPL2P10696 532 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 TYRP14679 529 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 MSH3P20585 1137 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 RRM2P31350 389 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 KRT20P35900 424 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 CLDN8P56748 225 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 ERVFC1P60507 584 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 ACSM2AQ08AH3 577 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 ACOX1Q15067 660 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 ACSM2BQ68CK6 577 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 USP45Q70EL2 814 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 C11orf96Q7Z7L8 435 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 FAM217AQ8IXS0 508 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 CFAP206Q8IYR0 622 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 HUS1BQ8NHY5 278 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 FAR1Q8WVX9 515 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 DTNBP1Q96EV8 351 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 MAGED4Q96JG8 741 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 PHOX2BQ99453 314 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 TPT1P8Q9HAU6 139 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 TM7SF3Q9NS93 570 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 PPM1DO15297 605 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 NTN1O95631 604 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 ADRA2AP08913 450 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 OR56A5P0C7T3 313 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 NKX3-2P78367 333 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 GRIK2Q13002 908 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 SLC13A2Q13183 592 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 CTF1Q16619 201 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 TTLL9Q3SXZ7 439 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 LEXMQ3ZCV2 418 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 SYTL3Q4VX76 610 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 OR2T5Q6IEZ7 315 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 TMEM220Q6QAJ8 160 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 DCDC5Q6ZRR9 648 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 ADHFE1Q8IWW8 467 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 ZZZ3Q8IYH5 903 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 SLC39A11Q8N1S5 342 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 OR2T29Q8NH02 315 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 DOK4Q8TEW6 326 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 TSPEARQ8WU66 669 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 DNASE1L2Q92874 299 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 ARSGQ96EG1 525 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 LRRC3BQ96PB8 259 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 FAM83DQ9H4H8 585 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 TBC1D23Q9NUY8 699 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 DNAJC11Q9NVH1 559 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 PSME2Q9UL46 239 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 TRIM64A6NGJ6 449 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 PRAMEF25A6NGN4 478 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 LRRTM2O43300 516 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 ATP6V1G1O75348 118 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 APOL3O95236 402 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS1-201ENST00000262460 CXCL14O95715 111 aa8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms