RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 CLDN19Q8N6F1 224 aa15.46■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 POGLUT1Q8NBL1 392 aa15.46■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 IPMKQ8NFU5 416 aa15.46■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 ZUFSPQ96AP4 578 aa15.46■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 HAUS1Q96CS2 278 aa15.46■□□□□ 0.07
SPCS1-201ENST00000233025 MVB12AQ96EY5 273 aa15.46■□□□□ 0.07
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SPCS1-201ENST00000233025 KLK4Q9Y5K2 254 aa15.46■□□□□ 0.07
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SPCS1-201ENST00000233025 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
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SPCS1-201ENST00000233025 Q9UFV3 132 aa15.44■□□□□ 0.06
SPCS1-201ENST00000233025 CIDEBQ9UHD4 219 aa15.44■□□□□ 0.06
SPCS1-201ENST00000233025 TRPS1Q9UHF7 1281 aa15.44■□□□□ 0.06
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SPCS1-201ENST00000233025 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
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SPCS1-201ENST00000233025 C11orf63Q6NUN7 778 aa15.43■□□□□ 0.06
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SPCS1-201ENST00000233025 SERPINA9Q86WD7 417 aa15.43■□□□□ 0.06
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa15.43■□□□□ 0.06
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SPCS1-201ENST00000233025 FAM215AQ9Y5M1 114 aa15.43■□□□□ 0.06
SPCS1-201ENST00000233025 ABCA1O95477 2261 aa15.42■□□□□ 0.06
SPCS1-201ENST00000233025 C5orf60A6NFR6 353 aa15.42■□□□□ 0.06
SPCS1-201ENST00000233025 HACD1B0YJ81 288 aa15.42■□□□□ 0.06
SPCS1-201ENST00000233025 CCL22O00626 93 aa15.42■□□□□ 0.06
SPCS1-201ENST00000233025 CDK2AP1O14519 115 aa15.42■□□□□ 0.06
SPCS1-201ENST00000233025 WIPF1O43516 503 aa15.42■□□□□ 0.06
SPCS1-201ENST00000233025 FOXS1O43638 330 aa15.42■□□□□ 0.06
SPCS1-201ENST00000233025 CRLF1O75462 422 aa15.42■□□□□ 0.06
SPCS1-201ENST00000233025 AP2A2O94973 939 aa15.42■□□□□ 0.06
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