RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Patl1Q3TC46 770 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Eif1adQ3THJ3 170 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hdgfl2Q3UMU9 669 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bhlha9Q5RJB0 231 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Foxs1Q61574 329 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fgfr3Q61851 801 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mfsd13aQ6PDE8 519 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sox11Q7M6Y2 395 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1085Q7TR64 313 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem62Q8BXJ9 643 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam110bQ8C739 366 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cdkl1Q8CEQ0 352 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 LctlQ8K1F9 566 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cd207Q8VBX4 331 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam3cQ91VU0 227 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Abcg4Q91WA9 646 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ugt2b38Q91WH2 530 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem98Q91X86 226 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pcdha8Q91Y12 946 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dsn1Q9CYC5 348 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pus10Q9D3U0 527 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ribc2Q9D4Q1 309 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 HaghlQ9DB32 283 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc13a2Q9ES88 586 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 NpvfQ9ESQ8 188 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ap3m1Q9JKC8 418 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc25a13Q9QXX4 676 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Smok1Q9QYZ4 484 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm21083A0A0G2JFD5 256 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cd300ld2A2A7W0 305 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Acnat1A2AKK5 416 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 4930595M18RikA2RRY9 829 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tceal7A3KGA4 98 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Phf11cB4XVP9 339 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ap1arE9PYF7 298 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp558E9Q1J0 407 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Speer4cG3UXD1 256 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm10354K7N6A0 256 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nrp2O35375 931 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ly6dP35459 127 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prdx1P35700 199 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sat1P48026 171 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 RabggtbP53612 339 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rin3P59729 980 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mapk1P63085 358 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tuba1cP68373 449 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sec24aQ3U2P1 1090 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trim40Q3UWA4 246 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bpifb1Q61114 474 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 OgnQ62000 298 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem151bQ68FE7 561 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Brinp2Q6DFY8 783 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc25a23Q6GQS1 467 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rnf220Q6PDX6 566 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Otop2Q80SX5 563 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spon2Q8BMS2 330 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q8C3W1 322 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nudt13Q8JZU0 352 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn1r87Q8R255 295 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr330Q8VGD9 315 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Atg13Q91YI1 516 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PrkxQ922R0 355 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Camk2gQ923T9 529 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cyp2j9Q924D1 502 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cdh23Q99PF4 3354 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ist1Q9CX00 362 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mgme1Q9CXC3 338 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Snx7Q9CY18 387 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cep97Q9CZ62 856 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mgat4dQ9D4R2 373 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tuba8Q9JJZ2 449 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dnajb1Q9QYJ3 340 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vps29Q9QZ88 182 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cacna1dQ99246 2179 aa9.89□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 D3Ertd254eA0A0G2JEM5 796 aa9.89□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trmt1lA2RSY6 728 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Itih4A6X935 942 aa9.89□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm10477F6SW83 55 aa9.89□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 1700122O11RikJ3QPW6 241 aa9.89□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bard1O70445 765 aa9.89□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Timp2P25785 220 aa9.89□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Elk4P41158 430 aa9.89□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Stat6P52633 837 aa9.89□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cxcl17Q5UW37 119 aa9.89□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Jak3Q62137 1100 aa9.89□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 ThrspQ62264 150 aa9.89□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Wnt8aQ64527 354 aa9.89□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bhlhb9Q6PB60 539 aa9.89□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rmnd5aQ80YQ8 391 aa9.89□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Csgalnact1Q8BJQ9 530 aa9.89□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Arhgap28Q8BN58 729 aa9.89□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kremen2Q8K1S7 461 aa9.89□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 ManbaQ8K2I4 879 aa9.89□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Il23rQ8K4B4 644 aa9.89□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn1r206Q8R277 312 aa9.89□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 ClyblQ8R4N0 338 aa9.89□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 NgrnQ99KS2 293 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gins4Q99LZ3 223 aa9.89□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rnf186Q9D241 226 aa9.89□□□□□ -0.83
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ephx1Q9D379 455 aa9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.9 ms