RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		14.87	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		14.87	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		14.87	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	LRCH3	Q96II8	777 aa		14.87	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SEPHS2	Q99611	448 aa		14.87	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PBX4	Q9BYU1	374 aa		14.87	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		14.87	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		14.87	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		14.87	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	OPTC	Q9UBM4	332 aa		14.87	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	FBXO10	Q9UK96	956 aa		14.87	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	BPTF	Q12830	3046 aa		14.87	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1W2PQ67	120 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SHOX	O15266	292 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ANGPTL1	O95841	491 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CYP17A1	P05093	508 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	MTHFR	P42898	656 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SEPHS1	P49903	392 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	KCNAB2	Q13303	367 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	RCAN2	Q14206	197 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CARTPT	Q16568	116 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PTPRN	Q16849	979 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM215	Q68D42	235 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PLPP6	Q8IY26	295 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SGCD	Q92629	289 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	LYSMD1	Q96S90	227 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CLDN7	O95471	211 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ANXA6	P08133	673 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ADH5	P11766	374 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CD1D	P15813	335 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CHRM3	P20309	590 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	VIPR2	P41587	438 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PTGER3	P43115	390 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SLC35A2	P78381	396 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	EMX2	Q04743	252 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CDK5R2	Q13319	367 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	KCNC3	Q14003	757 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	EML3	Q32P44	896 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	COLEC12	Q5KU26	742 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ISCA2	Q86U28	154 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	STK40	Q8N2I9	435 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	MSRA	Q9UJ68	235 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		14.86	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	HMX3	A6NHT5	357 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	WASH3P	C4AMC7	463 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PTGES3L	E9PB15	166 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	OR1I1	O60431	355 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ADH1C	P00326	375 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CISD3	P0C7P0	127 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SPN	P16150	400 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ITGA2	P17301	1181 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CD9	P21926	228 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	FSHR	P23945	695 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	HRH2	P25021	359 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PSMB9	P28065	219 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NCS1	P62166	190 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	GLYAT	Q6IB77	296 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659		Q6ZVU0	165 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	EID3	Q8N140	333 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CHST14	Q8NCH0	376 aa		14.85	□□□□□ -0.03

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