RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614051.1

CCL3-206, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3, Length 1,494 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3-206ENST00000614051 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 STPG1Q5TH74 334 aa14.95□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 ATG9BQ674R7 924 aa14.95□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 CGB2Q6NT52 195 aa14.95□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 FAM92BQ6ZTR7 304 aa14.95□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 ADCK2Q7Z695 626 aa14.95□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 CRLF3Q8IUI8 442 aa14.95□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 PLD3Q8IV08 490 aa14.95□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 L3MBTL4Q8NA19 623 aa14.95□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 NAT6Q93015 286 aa14.95□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 FAM107BQ9H098 131 aa14.95□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 CACNA1AO00555 2505 aa14.95□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 SPEGQ15772 3267 aa14.95□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 CEP250Q9BV73 2442 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 A0A1W2PQM1 296 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 FEZF1A0PJY2 475 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 GMNCA6NCL1 334 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 GIPC1O14908 333 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 AZIN1O14977 448 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 DUX1O43812 170 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 CBFA2T3O75081 653 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 CRCPO75575 148 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 CKMT2P17540 419 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 MAGP20916 626 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 GRIA3P42263 894 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 RPL14P50914 215 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 CCR8P51685 355 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 CSNK1G2P78368 415 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 SLC5A12Q1EHB4 618 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 KANK2Q63ZY3 851 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 ADNP2Q6IQ32 1131 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 SCIMPQ6UWF3 145 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 FAM129CQ86XR2 697 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 ABHD11Q8NFV4 315 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 METTL6Q8TCB7 284 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 GRAMD1AQ96CP6 724 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 MAP3K3Q99759 626 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 NUDT22Q9BRQ3 303 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 ZMYND15Q9H091 742 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 PELI2Q9HAT8 420 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 KLHL3Q9UH77 587 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 TRPS1Q9UHF7 1281 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 HAO1Q9UJM8 370 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 STK38LQ9Y2H1 464 aa14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 DCHS1Q96JQ0 3298 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 A0A0J9YY10 115 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 CCNDBP1O95273 360 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 JUNP05412 331 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 FGF4P08620 206 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 JUPP14923 745 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 DRD4P21917 467 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 CDH3P22223 829 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 CASP2P42575 452 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 HTR6P50406 440 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 GPLD1P80108 840 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 ABATP80404 500 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 PCDH1Q08174 1060 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 TBCCQ15814 346 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 UGT3A2Q3SY77 523 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 SGO1Q5FBB7 561 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 SNAP47Q5SQN1 464 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 LIPJQ5W064 366 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 FCRL6Q6DN72 434 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 GRHL2Q6ISB3 625 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 FIGLAQ6QHK4 219 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 CLYBLQ8N0X4 340 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 RNF175Q8N4F7 328 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 OR4K1Q8NGD4 311 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 RFWD2Q8NHY2 731 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 WDR34Q96EX3 536 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 PPP1R36Q96LQ0 422 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 HBEGFQ99075 208 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 LRRN3Q9H3W5 708 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 EHD1Q9H4M9 534 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 BTRCQ9Y297 605 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa14.93□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 MATN2O00339 956 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 MANBAO00462 879 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 HAT1O14929 419 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 UGDHO60701 494 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL3-206ENST00000614051 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 310.6 ms