RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PET100P0DJ07 73 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CHRNB2P17787 502 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GRK5P34947 590 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ADRA1BP35368 520 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 XKP51811 444 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TAS2R43P59537 309 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PFKPQ01813 784 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PCDH1Q08174 1060 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PON3Q15166 354 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TRAM1Q15629 374 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 HSDL1Q3SXM5 330 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GPR158Q5T848 1215 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CEP97Q8IW35 865 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 LGI4Q8N135 537 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 LIX1Q8N485 282 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 OR7G2Q8NG99 324 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TSSK3Q96PN8 268 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TXLNGYQ9BZA5 131 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 LHPPQ9H008 270 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 LMAN2LQ9H0V9 348 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ITM2CQ9NQX7 267 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TVP23BQ9NYZ1 205 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TIMM22Q9Y584 194 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SMCO3A2RU48 225 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 AGAP5A6NIR3 686 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 MATN3O15232 486 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 RPS2P15880 293 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 LHCGRP22888 699 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 HTR1EP28566 365 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 WEE1P30291 646 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CD52P31358 61 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SLC5A2P31639 672 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 EVI2BP34910 448 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CASP3P42574 277 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 RAB5CP51148 216 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CLCN4P51793 760 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ARF1P84077 181 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GRM2Q14416 872 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PCLAFQ15004 111 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CXCL17Q6UXB2 119 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TPGS1Q6ZTW0 290 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CERS5Q8N5B7 392 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 COQ10AQ96MF6 247 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 RIPOR3Q96MK2 946 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 AP1S3Q96PC3 154 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 KCNC2Q96PR1 638 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF416Q9BWM5 594 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 LGR4Q9BXB1 951 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 MROQ9BYG7 248 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM184CQ9NVA4 438 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CNTN3Q9P232 1028 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM181Q9P2C4 612 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 C10orf71Q711Q0 1435 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 AP1G1O43747 822 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 RAB36O95755 333 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PKMP14618 531 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ITGB5P18084 799 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CFL1P23528 166 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CMPK1P30085 196 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 DGKQP52824 942 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 WNT3AP56704 352 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GAD2Q05329 585 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 KCNAB2Q13303 367 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 KCNJ11Q14654 390 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 EML3Q32P44 896 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 CLVS2Q5SYC1 327 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 MEDAGQ5VYS4 303 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TTLQ8NG68 377 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SLC22A8Q8TCC7 542 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 SLC9A6Q92581 669 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 GTF2H4Q92759 462 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PTERQ96BW5 349 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF597Q96LX8 424 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 PDZD7Q9H5P4 517 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CLCN3-211ENST00000613795 DAPL1A0PJW8 107 aa6.7□□□□□ -1.34
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