RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606828.2

MED16-211, Transcript of mediator complex subunit 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MED16, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16-211ENST00000606828 MAGEA4P43358 317 aa13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 OR1D4P47884 311 aa13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 CCL11P51671 97 aa13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 TAS2R39P59534 338 aa13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 SLC7A5Q01650 507 aa13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 POU4F1Q01851 419 aa13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 TRADDQ15628 312 aa13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 PRTGQ2VWP7 1150 aa13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 CPZQ66K79 652 aa13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 ZDHHC24Q6UX98 284 aa13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 ATG14Q6ZNE5 492 aa13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 C17orf64Q86WR6 236 aa13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 ANKRD7Q92527 254 aa13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 COL26A1Q96A83 441 aa13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 NACC2Q96BF6 587 aa13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 CPNE1Q99829 537 aa13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 MCMBPQ9BTE3 642 aa13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 SGPP1Q9BX95 441 aa13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 SLC26A1Q9H2B4 701 aa13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 POPDC3Q9HBV1 291 aa13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 GPAMQ9HCL2 828 aa13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 ZNF304Q9HCX3 659 aa13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 SMYD2Q9NRG4 433 aa13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 CDC14AQ9UNH5 594 aa13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 ESYT3A0FGR9 886 aa13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 HAT1O14929 419 aa13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 GUCA1CO95843 209 aa13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 IGHEP01854 428 aa13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 GRK3P35626 688 aa13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 CHAF1BQ13112 559 aa13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 ATP1A4Q13733 1029 aa13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 ZNF460Q14592 562 aa13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 NKG7Q16617 165 aa13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 HKDC1Q2TB90 917 aa13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 GARNL3Q5VVW2 1013 aa13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 LCTLQ6UWM7 567 aa13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 SBSNQ6UWP8 590 aa13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 TMEM207Q6UWW9 146 aa13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 ASB18Q6ZVZ8 466 aa13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 MRGPREQ86SM8 312 aa13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 CTAGE3PQ8IX95 158 aa13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 MNS1Q8NEH6 495 aa13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 FBXL8Q96CD0 374 aa13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 MVB12AQ96EY5 273 aa13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 TSPAN17Q96FV3 270 aa13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 HAUS8Q9BT25 410 aa13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 LRRC1Q9BTT6 524 aa13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 SLC25A23Q9BV35 468 aa13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 MAU2Q9Y6X3 613 aa13.05□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 SEC16AO15027 2179 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 FAM159BA6NKW6 160 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 J3QKU1 62 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP13.04□□□□□ -0.324e-7■■■■■ 27.5
MED16-211ENST00000606828 MED26O95402 600 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 UMODP07911 640 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 NPPBP16860 134 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 STX2P32856 288 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 GP5P40197 560 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 PGDP52209 483 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 GPX6P59796 221 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 CSNK1G2P78368 415 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 GUCY2DQ02846 1103 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 OCA2Q04671 838 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 USP10Q14694 798 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 PPP1R3AQ16821 1122 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 COX15Q7KZN9 410 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 PLD3Q8IV08 490 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 CEP97Q8IW35 865 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 CLEC1AQ8NC01 280 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 OR56A3Q8NH54 315 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 PYCR2Q96C36 320 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 THAP11Q96EK4 314 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 C10orf90Q96M02 699 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 SPSB2Q99619 263 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 RBBP8Q99708 897 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 FAM129AQ9BZQ8 928 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 SYNPO2LQ9H987 977 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 P4HTMQ9NXG6 502 aa13.04□□□□□ -0.32
MED16-211ENST00000606828 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms