RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 FAM72AQ5TYM5 149 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 FAM72DQ6L9T8 149 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 CHST9Q7L1S5 443 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 STRADAQ7RTN6 431 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 FAM72BQ86X60 149 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 MARCH9Q86YJ5 346 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF683Q8IZ20 524 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 PYROXD2Q8N2H3 581 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 OR52K2Q8NGK3 314 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 KLHL29Q96CT2 875 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 LMLNQ96KR4 655 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 GPR78Q96P69 363 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 PEBP4Q96S96 227 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 CNPY3Q9BT09 278 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 NUP85Q9BW27 656 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 GPR174Q9BXC1 333 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 FSD1LQ9BXM9 530 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 SLC2A11Q9BYW1 496 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 CIPCQ9C0C6 399 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 SERTAD4Q9NUC0 356 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 SEMA5BQ9P283 1151 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 SLC25A13Q9UJS0 675 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 GGA2Q9UJY4 613 aa7.58□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 COL6A6A6NMZ7 2263 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1B0GVM2 712 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 LIPT2A6NK58 231 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 WASH3PC4AMC7 463 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 PRYO14603 147 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 CHRM4P08173 479 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 HLA-EP13747 358 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 PLA2G2AP14555 144 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 OXTRP30559 389 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 ADRA1BP35368 520 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 GJC1P36383 396 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 CSKP41240 450 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 SELENOPP49908 381 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 BNC1Q01954 994 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 CFHR3Q02985 330 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 MED22Q15528 200 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 CA9Q16790 459 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 PLAC9Q5JTB6 97 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 MPP7Q5T2T1 576 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF585AQ6P3V2 769 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 KRT74Q7RTS7 529 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 RNF144BQ7Z419 303 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 ADIPOR2Q86V24 386 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 APCDD1Q8J025 514 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 IL17DQ8TAD2 202 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 FIBINQ8TAL6 211 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 NXPE2Q96DL1 559 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 KLHL15Q96M94 604 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 CCDC42Q96M95 316 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 Q96MF0 132 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 TXLNGYQ9BZA5 131 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 PCED1AQ9H1Q7 454 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 PARPBPQ9NWS1 579 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 GIMAP2Q9UG22 337 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 PCSK1NQ9UHG2 260 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 ANAPC7Q9UJX3 599 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 FZD10Q9ULW2 581 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 TFR2Q9UP52 801 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 NEU3Q9UQ49 428 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 BTBD3Q9Y2F9 522 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 PKP3Q9Y446 797 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 TCAF1Q9Y4C2 921 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 CKAP5Q14008 2032 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 PTPN13Q12923 2485 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 SHROOM3Q8TF72 1996 aa7.57□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM131Q92545 1883 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1B0GVT2 93 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 FAM149AA5PLN7 773 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 TTC34A8MYJ7 566 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 H0YIZ8 118 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 DSCR3O14972 297 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 LRCH4O75427 683 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 IGLV3-19P01714 112 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 NPSP0C0P6 89 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 H2AFZP0C0S5 128 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 APEHP13798 732 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 IL11P20809 199 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 MIPP30301 263 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 PSMB10P40306 273 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 CPA2P48052 419 aa7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 STK19P49842 368 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ATG4D-210ENST00000588972 CCT8P50990 548 aa7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms