RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	GPR157	Q5UAW9	335 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	KRT77	Q7Z794	578 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	AMER2	Q8N7J2	671 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	SGCD	Q92629	289 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68	8e-7	■■■■■ 40.3
MSI2-216	ENST00000582772	LRRC58	Q96CX6	371 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	TBCB	Q99426	244 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	SLC6A7	Q99884	636 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	KCNK13	Q9HB14	408 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	SYBU	Q9NX95	663 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	MPP6	Q9NZW5	540 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772		A0A1W2PQ67	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	MSTN	O14793	375 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	KMO	O15229	486 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	CLSTN1	O94985	981 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	PROC	P04070	461 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	THBD	P07204	575 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	HLA-DPA1	P20036	260 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	TNFAIP3	P21580	790 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	CASP1	P29466	404 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	CD79B	P40259	229 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	MAPKAPK2	P49137	400 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	DIO3	P55073	304 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	MYL5	Q02045	173 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	PTP4A2	Q12974	167 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	NFYC	Q13952	458 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	SLC10A1	Q14973	349 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	ZIC1	Q15915	447 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	EXT1	Q16394	746 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	BTBD16	Q32M84	506 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	LEG1	Q6P5S2	330 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	LRRC31	Q6UY01	552 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	SATL1	Q86VE3	508 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	TMEM139	Q8IV31	216 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	PHF21A	Q96BD5	680 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	THAP11	Q96EK4	314 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	ALG2	Q9H553	416 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	DEPP	Q9NTK1	212 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	DDIT4	Q9NX09	232 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MSI2-216	ENST00000582772	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	TRGV5	A0A0B4J1U4	118 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	FITM1	A5D6W6	292 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	FAM166B	A8MTA8	275 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772		A8MX80	341 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772		H7C417	338 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	KCNJ13	O60928	360 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	ZFPL1	O95159	310 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MSI2-216	ENST00000582772	GCNT3	O95395	438 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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