RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	SHISA5	Q8N114	240 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	MPP5	Q8N3R9	675 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	MVB12A	Q96EY5	273 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	FOPNL	Q96NB1	174 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	OR2A5	Q96R48	311 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	DESI2	Q9BSY9	194 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	ABI3	Q9P2A4	366 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	GALP	Q9UBC7	116 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	MYO1C	O00159	1063 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	CCL21	O00585	134 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	VPS26A	O75436	327 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	WFS1	O76024	890 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	RASAL1	O95294	804 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	FMO4	P31512	558 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	CA7	P43166	264 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF75D	P51815	510 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	NAA25	Q14CX7	972 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM205	Q6UW68	189 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	CES3	Q6UWW8	571 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM139	Q8IV31	216 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	SMPDL3A	Q92484	453 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	LPGAT1	Q92604	370 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	MFSD3	Q96ES6	412 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	RNF32	Q9H0A6	362 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	PAK5	Q9P286	719 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	TAC3	Q9UHF0	121 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	NF1	P21359	2839 aa		11.93	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	MTOR	P42345	2549 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	ZFHX3	Q15911	3703 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	OR5H15	A6NDH6	313 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	PRAMEF2	O60811	474 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	PHF2	O75151	1096 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	VAPB	O95292	243 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	HTR1E	P28566	365 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	ATP5D	P30049	168 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF33B	Q06732	778 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	KIF5A	Q12840	1032 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	ICE2	Q659A1	982 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	PLD3	Q8IV08	490 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC89	Q8N998	374 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	PKP4	Q99569	1192 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	IL22	Q9GZX6	179 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	DRC3	Q9H069	523 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	RUBCNL	Q9H714	662 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	SYBU	Q9NX95	663 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		11.92	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	HAT1	O14929	419 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	STATH	P02808	62 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	ANXA5	P08758	320 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		11.91	□□□□□ -0.5
LETMD1-231	ENST00000551931	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5

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