RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527644.1

TSPAN4-217, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-217ENST00000527644 FAM159BA6NKW6 160 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 TXNDC9O14530 226 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 PIAS1O75925 651 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 PLA2G2AP14555 144 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 POU4F1Q01851 419 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 TCTN3Q6NUS6 607 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 PRMT9Q6P2P2 845 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 CSNK1A1LQ8N752 337 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 ATL1Q8WXF7 558 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 CPNE1Q99829 537 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 SGPP1Q9BX95 441 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 TRIM55Q9BYV6 548 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC26A1Q9H2B4 701 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 WDR54Q9H977 334 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 ANKRD12Q6UB98 2062 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 HAT1O14929 419 aa25.15■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 DNAJB5O75953 348 aa25.15■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 OTX2P32243 289 aa25.15■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 OR1D4P47884 311 aa25.15■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC12A2P55011 1212 aa25.15■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 CPZQ66K79 652 aa25.15■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 LCTLQ6UWM7 567 aa25.15■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 SBSNQ6UWP8 590 aa25.15■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 MED25Q71SY5 747 aa25.15■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 C17orf64Q86WR6 236 aa25.15■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 FBXL8Q96CD0 374 aa25.15■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 CABS1Q96KC9 395 aa25.15■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 SYNPO2LQ9H987 977 aa25.15■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF304Q9HCX3 659 aa25.15■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 CCDC88CQ9P219 2028 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 ESYT3A0FGR9 886 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 MED26O95402 600 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 RRADP55042 308 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF460Q14592 562 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 GARNL3Q5VVW2 1013 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 COX15Q7KZN9 410 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 CEP97Q8IW35 865 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 MMGT1Q8N4V1 131 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 MNS1Q8NEH6 495 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 OR56A3Q8NH54 315 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 C10orf90Q96M02 699 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 HAUS8Q9BT25 410 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 GPAMQ9HCL2 828 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 IKZF3Q9UKT9 509 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
TSPAN4-217ENST00000527644 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 SUV39H1O43463 412 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC28A2O43868 658 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 GUCA1CO95843 209 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 C1QAP02745 245 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 NPPBP16860 134 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 GP5P40197 560 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 CCL11P51671 97 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 CHAF1BQ13112 559 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 ATP1A4Q13733 1029 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 NKG7Q16617 165 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 MRGPREQ86SM8 312 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 NACC2Q96BF6 587 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 THAP11Q96EK4 314 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 MVB12AQ96EY5 273 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 TSPAN17Q96FV3 270 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 RBBP8Q99708 897 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 CDC14AQ9UNH5 594 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 MAU2Q9Y6X3 613 aa25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 CDC7O00311 574 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 IGHEP01854 428 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 UMODP07911 640 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 STX2P32856 288 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 CSNK1G2P78368 415 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 GUCY2DQ02846 1103 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 PPP1R3AQ16821 1122 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 HKDC1Q2TB90 917 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 PLD3Q8IV08 490 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 CTAGE3PQ8IX95 158 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 DTWD1Q8N5C7 304 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 ANKRD49Q8WVL7 239 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 COL26A1Q96A83 441 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 GPR22Q99680 433 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 SH2B3Q9UQQ2 575 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
TSPAN4-217ENST00000527644 MED13Q9UHV7 2174 aa25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms