RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516876.1

RNU6-928P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 928, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-928P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-928P-201ENST00000516876 RPP38P78345 283 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 COG7P83436 770 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 HSF2Q03933 536 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 RUNX1T1Q06455 604 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 PRKAA1Q13131 559 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 CHIT1Q13231 466 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 SGCGQ13326 291 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 LAMB3Q13751 1172 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 PDIA5Q14554 519 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF124Q15973 351 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 STX1AQ16623 288 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 CA9Q16790 459 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 NADK2Q4G0N4 442 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 RAB6CQ53S08 254 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 BOLA3Q53S33 107 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 ARMCX4Q5H9R4 360 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 C20orf194Q5TEA3 1177 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 STRIP1Q5VSL9 837 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 OR4A47Q6IF82 309 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 UGT3A1Q6NUS8 523 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 ARMCX2Q7L311 632 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 VASH2Q86V25 355 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 VPS36Q86VN1 386 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 GLCCI1Q86VQ1 547 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 PTOV1Q86YD1 416 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 CROCCP3Q8IVE0 287 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM114A1Q8IWE2 563 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 FOXRED2Q8IWF2 684 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 LGI2Q8N0V4 545 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 CERS5Q8N5B7 392 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 GBGT1Q8N5D6 347 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 TMEM99Q8N816 258 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 ACVR1CQ8NER5 493 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 OR52M1Q8NGK5 317 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 OR52I2Q8NH67 350 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 GANCQ8TET4 914 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 SELENOMQ8WWX9 145 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 RLN3Q8WXF3 142 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 RND1Q92730 232 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 ESAMQ96AP7 390 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 PHF21AQ96BD5 680 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 CCDC51Q96ER9 411 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 ABHD8Q96I13 439 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 TXNDC15Q96J42 360 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 CNDP1Q96KN2 507 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 CFAP53Q96M91 514 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 OR1F2PQ96R84 312 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 COQ7Q99807 217 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 NEURL2Q9BR09 285 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC2A11Q9BYW1 496 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 VN1R1Q9GZP7 353 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 RAB6CQ9H0N0 254 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 Q9H8V8 135 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 TM9SF3Q9HD45 589 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 Q9N2K0 584 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 ACKR4Q9NPB9 350 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 CHST11Q9NPF2 352 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 CD93Q9NPY3 652 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 SEMA4GQ9NTN9 838 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 NMRK1Q9NWW6 199 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 ATXN10Q9UBB4 475 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 ENTPD4Q9Y227 616 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 A0A0G2JK05 382 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 A0A1W2PPK0 400 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 A0A1W2PRB8 838 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 hDV102S1A0JD36 115 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 TRIM49BA6NDI0 452 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 LILRA5A6NI73 299 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 PRSS46E5RG02 174 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 FOXN1O15353 648 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 MTX2O75431 263 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 TOM1L1O75674 476 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 GCP02774 474 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 RAF1P04049 648 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 PRKCGP05129 697 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 RRASP10301 218 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF20P17024 532 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 CYP2F1P24903 491 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 HTR2AP28223 471 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 ARRB2P32121 409 aa2.88□□□□□ -1.95
RNU6-928P-201ENST00000516876 HSPA1LP34931 641 aa2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 149.8 ms