RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 H7BY64 318 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NDC80O14777 642 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TTI1O43156 1089 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZGLP1P0C6A0 271 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HIST1H2ADP20671 130 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCND1P24385 295 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ITGA8P53708 1063 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IL2P60568 153 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM53BQ14153 422 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIRREL2Q6UWL6 708 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPNS2Q8IVW8 549 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DTWD1Q8N5C7 304 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EFCAB3Q8N7B9 438 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CPT1CQ8TCG5 803 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STT3BQ8TCJ2 826 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TM9SF4Q92544 642 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MIEF2Q96C03 454 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SNF8Q96H20 258 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PWWP2AQ96N64 755 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRAP1Q96NZ9 151 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HIST1H2AJQ99878 128 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 H2AFJQ9BTM1 129 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PYCARDQ9ULZ3 195 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHMP2BQ9UQN3 213 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TP73O15350 636 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VPS4BO75351 444 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC26A3P40879 764 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KLC1Q07866 573 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAPSNQ13702 412 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DSG2Q14126 1118 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RBBP7Q16576 425 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HKDC1Q2TB90 917 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HECTD2Q5U5R9 776 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC6A19Q695T7 634 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AGTRAPQ6RW13 159 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ADCK2Q7Z695 626 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GALNT11Q8NCW6 608 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BBOF1Q8ND07 529 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 THAP11Q96EK4 314 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRIM51Q9BSJ1 452 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SYNPO2LQ9H987 977 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLAMF7Q9NQ25 335 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ABCF3Q9NUQ8 709 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FBXL4Q9UKA2 621 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 VPS4AQ9UN37 437 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLEC18AA5D8T8 446 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EFCAB8A8MWE9 144 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 E7ESA3 106 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCDH17O14917 1159 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HAT1O14929 419 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TSPAN12O95859 305 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FBLP22087 321 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FDXRP22570 491 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TBPL1P62380 186 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NDUFA9Q16795 377 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TUBB8Q3ZCM7 444 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATG9BQ674R7 924 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM45BPQ6NSW5 357 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLEC18BQ6UXF7 455 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZADH2Q8N4Q0 377 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 Q8NA96 180 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLEC18CQ8NCF0 446 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR11G2Q8NGC1 345 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM45AQ8TCE6 357 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINGO1Q96FE5 620 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CFAP36Q96G28 342 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CRB3Q9BUF7 120 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MFRPQ9BY79 579 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRIM54Q9BYV2 358 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM129AQ9BZQ8 928 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TGIF2Q9GZN2 237 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DRC3Q9H069 523 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MOCS1Q9NZB8 636 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MASP2O00187 686 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms