RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 FAM118AQ9NWS6 357 aa4.02□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 DONSONQ9NYP3 566 aa4.02□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 CACNG4Q9UBN1 327 aa4.02□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 DAPK2Q9UIK4 370 aa4.02□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 MTUS1Q9ULD2 1270 aa4.02□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 SNX7Q9UNH6 387 aa4.02□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa4.02□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 FLT1P17948 1338 aa4.01□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 ZBED9Q6R2W3 1325 aa4.01□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa4.01□□□□□ -1.77
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POLR1B-215ENST00000498054 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
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POLR1B-215ENST00000498054 C6orf136Q5SQH8 315 aa4.01□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa4.01□□□□□ -1.77
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POLR1B-215ENST00000498054 DHX58Q96C10 678 aa4.01□□□□□ -1.77
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POLR1B-215ENST00000498054 FNBP1Q96RU3 617 aa4.01□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 RAD9AQ99638 391 aa4.01□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 SNX25Q9H3E2 840 aa4.01□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 TXNDC16Q9P2K2 825 aa4.01□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 LRWD1Q9UFC0 647 aa4.01□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 NCAPD2Q15021 1401 aa4.01□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 BCORQ6W2J9 1755 aa4.01□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 CNTNAP1P78357 1384 aa4.01□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 PALLDQ8WX93 1383 aa4.01□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 USP47Q96K76 1375 aa4.01□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 TRPM7Q96QT4 1865 aa4.01□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 VCANP13611 3396 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 KIF20BQ96Q89 1820 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 TTC21AQ8NDW8 1320 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 A0A1W2PPW3 197 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 HTR3EA5X5Y0 456 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 ANKRD61A6NGH8 418 aa4□□□□□ -1.77
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POLR1B-215ENST00000498054 TGDSO95455 350 aa4□□□□□ -1.77
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POLR1B-215ENST00000498054 PLA2G4BP0C869 781 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 IRF2P14316 349 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 ITGB6P18564 788 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 HOXC8P31273 242 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 ITGA7Q13683 1181 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 CA9Q16790 459 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 UGP2Q16851 508 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 DCAF10Q5QP82 559 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 MPP7Q5T2T1 576 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 FAM91A1Q658Y4 838 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 LINGO4Q6UY18 593 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 MFSD6Q6ZSS7 791 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 SLC26A9Q7LBE3 791 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 SPATA19Q7Z5L4 167 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 GLRX5Q86SX6 157 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 LGI2Q8N0V4 545 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 EID3Q8N140 333 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 OR2T12Q8NG77 320 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 OR11H4Q8NGC9 324 aa4□□□□□ -1.77
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POLR1B-215ENST00000498054 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 NSMAFQ92636 917 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM143Q96AN5 459 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 SCRN2Q96FV2 425 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 LMLNQ96KR4 655 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 LRRC3BQ96PB8 259 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 INTS14Q96SY0 518 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 DESI2Q9BSY9 194 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 KDRP35968 1356 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 MUC3AQ02505 3323 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 LAMA3Q16787 3333 aa4□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 SMCHD1A6NHR9 2005 aa3.99□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa3.99□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 FAM86B1E9PN63 330 aa3.99□□□□□ -1.77
POLR1B-215ENST00000498054 FGF17O60258 216 aa3.99□□□□□ -1.77
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