RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	MIEF2	Q96C03	454 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246	PDE10A	Q9Y233	779 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1W2PPV9	198 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	FITM1	A5D6W6	292 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	URAD	A6NGE7	173 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246		H0YGG7	62 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDH17	O14917	1159 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	DPM1	O60762	260 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	GABRB3	P28472	473 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	SSTR1	P30872	391 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	MAGEA4	P43358	317 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP6V0D1	P61421	351 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	IL10RA	Q13651	578 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	CSHL1	Q14406	222 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	RBBP7	Q16576	425 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	GRTP1	Q5TC63	336 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	PAQR7	Q86WK9	346 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	CEP112	Q8N8E3	955 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	DRC3	Q9H069	523 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR83	Q9NYM4	423 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	MED16	Q9Y2X0	877 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	SPTB	P11277	2137 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	KRT87P	A6NCN2	255 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP2K7	O14733	419 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	CTSV	O60911	334 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	C1QL1	O75973	258 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	OR1D4	P47884	311 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	GUCY2D	Q02846	1103 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	RGS1	Q08116	209 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	CBLB	Q13191	982 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM53B	Q14153	422 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	SLMAP	Q14BN4	828 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	PPM1N	Q8N819	430 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXL8	Q96CD0	374 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	RUFY1	Q96T51	708 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	CRB3	Q9BUF7	120 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246		A6NL46	340 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246		H3BMH7	237 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	AGPS	O00116	658 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	HAT1	O14929	419 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	HCRTR1	O43613	425 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	SERPIND1	P05546	499 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	HEXB	P07686	556 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	FURIN	P09958	794 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	PLA2G2A	P14555	144 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	MMP11	P24347	488 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	CRABP2	P29373	138 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	RAB10	P61026	200 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	CDKL1	Q00532	357 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP1A4	Q13733	1029 aa		10.81	□□□□□ -0.68

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