RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495188.2

RNF146-208, Transcript of ring finger protein 146, human

TSL 2

Gene RNF146, Length 593 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF146-208	ENST00000495188	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	TAF6	P49848	677 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	SGCG	Q13326	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	CAMK2D	Q13557	499 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	NECTIN1	Q15223	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	PIK3R3	Q92569	461 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	NAA11	Q9BSU3	229 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	PAK5	Q9P286	719 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	IGHE	P01854	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	PRKACG	P22612	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	HNF4A	P41235	474 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	RAD23A	P54725	363 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	KCTD2	Q14681	263 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	OPCML	Q14982	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	PTPN14	Q15678	1187 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	LPAL2	Q16609	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	PTGIS	Q16647	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	C2CD6	Q53TS8	623 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	CTR9	Q6PD62	1173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	DOK6	Q6PKX4	331 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	EGFL8	Q99944	293 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	OR10A4	Q9H209	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	FZD8	Q9H461	694 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	FN3K	Q9H479	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	MED20	Q9H944	212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	POLL	Q9UGP5	575 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188		E9PQ18	207 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	RECQL5	O94762	991 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	CETN2	P41208	172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	XG	P55808	180 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	MZT1	Q08AG7	82 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	CDH18	Q13634	790 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	NOTUM	Q6P988	496 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	FCRLA	Q7L513	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	PKP2	Q99959	881 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	ACTL8	Q9H568	366 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	CRLF1	O75462	422 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	CDC25C	P30307	473 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	TAB1	Q15750	504 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	NUP37	Q8NFH4	326 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	PGM2	Q96G03	612 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	SPATA33	Q96N06	139 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	SERINC2	Q96SA4	455 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	MMP24	Q9Y5R2	645 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	CCDC188	H7C350	402 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	CCL24	O00175	119 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	BAG3	O95817	575 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	OR3A2	P47893	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	ADCK2	Q7Z695	626 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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