RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493536.5

SNHG16-202, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG16, Length 2,424 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG16-202ENST00000493536 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 CCR8P51685 355 aa8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 RPS13P62277 151 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 MTAPQ13126 283 aa8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 NFYCQ13952 458 aa8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 KIAA0040Q15053 153 aa8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 COQ5Q5HYK3 327 aa8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 ADNP2Q6IQ32 1131 aa8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 NOXRED1Q6NXP6 359 aa8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 WASH2PQ6VEQ5 465 aa8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 RETREG3Q86VR2 466 aa8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 TRIM48Q8IWZ4 208 aa8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 CAMKK1Q8N5S9 505 aa8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 LCN9Q8WX39 176 aa8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 WDR34Q96EX3 536 aa8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 SPACA7Q96KW9 195 aa8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 TSSK3Q96PN8 268 aa8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 AIF1LQ9BQI0 150 aa8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 SLC39A3Q9BRY0 314 aa8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 MENTQ9BUN1 341 aa8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 EBPLQ9BY08 206 aa8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 WASH6PQ9NQA3 447 aa8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 ASIC5Q9NY37 505 aa8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 DGKBQ9Y6T7 804 aa8.49□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 ANKDD1BA6NHY2 528 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 H7BY64 318 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 EML2O95834 649 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 TGFB1P01137 390 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 PCSK2P16519 638 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 ME2P23368 584 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 CXCL12P48061 93 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 BLKP51451 505 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 YBX1P67809 324 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 E2F2Q14209 437 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 PLCL1Q15111 1095 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 PGM2L1Q6PCE3 622 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 HACD2Q6Y1H2 254 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 PACS2Q86VP3 889 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 SYT12Q8IV01 421 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 LAS2Q8IYD9 372 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 LINC01555Q8NAE3 123 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 HIPK4Q8NE63 616 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 GPR156Q8NFN8 814 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 OR2L8Q8NGY9 312 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 CDC26Q8NHZ8 85 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 LRRC58Q96CX6 371 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 SLC6A18Q96N87 628 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 PRAP1Q96NZ9 151 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 GSDMCQ9BYG8 508 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 ACTL8Q9H568 366 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 MAP10Q9P2G4 905 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 MUTYHQ9UIF7 546 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 POMPQ9Y244 141 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 CROCCQ5TZA2 2017 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 VCANP13611 3396 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 METTL12A8MUP2 240 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 ANKRD28O15084 1053 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 EEDO75530 441 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 IL6P05231 212 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 SDC1P18827 310 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 CD27P26842 260 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 PKLRP30613 574 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 DPP6P42658 865 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 DGKQP52824 942 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 ACTR3P61158 418 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 SF1Q15637 639 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 SPIN4Q56A73 249 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 PIGGQ5H8A4 983 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 ICE2Q659A1 982 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 PRMT9Q6P2P2 845 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 TAF8Q7Z7C8 310 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 PARGQ86W56 976 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 ZNF740Q8NDX6 193 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 OR4E2Q8NGC2 313 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 CLDN23Q96B33 292 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 SPNS1Q9H2V7 528 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 DCLRE1BQ9H816 532 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.48□□□□□ -1.05
SNHG16-202ENST00000493536 ICKQ9UPZ9 632 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms