RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 NCF4Q15080 339 aa6.15□□□□□ -1.42
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CTDSPL-208ENST00000486978 BBS9Q3SYG4 887 aa6.15□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 CCSMST1Q4G0I0 132 aa6.15□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 MSS51Q4VC12 460 aa6.15□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa6.15□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 SPANXN3Q5MJ09 141 aa6.15□□□□□ -1.42
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CTDSPL-208ENST00000486978 PDIK1LQ8N165 341 aa6.15□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
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CTDSPL-208ENST00000486978 DLL4Q9NR61 685 aa6.15□□□□□ -1.42
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CTDSPL-208ENST00000486978 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 TXLNGQ9NUQ3 528 aa6.15□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.15□□□□□ -1.42
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CTDSPL-208ENST00000486978 MED16Q9Y2X0 877 aa6.15□□□□□ -1.42
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CTDSPL-208ENST00000486978 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 CTSBP07858 339 aa6.14□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 STSP08842 583 aa6.14□□□□□ -1.43
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CTDSPL-208ENST00000486978 CD1EP15812 388 aa6.14□□□□□ -1.43
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CTDSPL-208ENST00000486978 CBSP35520 551 aa6.14□□□□□ -1.43
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CTDSPL-208ENST00000486978 GCGRP47871 477 aa6.14□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ITGA8P53708 1063 aa6.14□□□□□ -1.43
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CTDSPL-208ENST00000486978 PER3P56645 1201 aa6.14□□□□□ -1.43
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CTDSPL-208ENST00000486978 KIAA0408Q6ZU52 694 aa6.14□□□□□ -1.43
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CTDSPL-208ENST00000486978 GALNT7Q86SF2 657 aa6.14□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa6.14□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.14□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.14□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.14□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
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