RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 CSF2RBP32927 897 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 GRIA3P42263 894 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 KRT6CP48668 564 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 CSNK1G2P78368 415 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 PHEXP78562 749 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 CCL7P80098 99 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 REEP5Q00765 189 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 GUCY1A3Q02108 690 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 DOC2AQ14183 400 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 NKAIN2Q5VXU1 208 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 MED27Q6P2C8 311 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 CYB5D1Q6P9G0 228 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 FIGLAQ6QHK4 219 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 PAQR7Q86WK9 346 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 CRLF3Q8IUI8 442 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 CLYBLQ8N0X4 340 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 LSMEM2Q8N112 164 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 OR4F6Q8NGB9 312 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 OR52B6Q8NGF0 335 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 TMEM74Q96NL1 305 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 TGM7Q96PF1 710 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 NRTNQ99748 197 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 SIKE1Q9BRV8 207 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 ABCF3Q9NUQ8 709 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 PPT2Q9UMR5 302 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 SNX6Q9UNH7 406 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 BTRCQ9Y297 605 aa12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
NISCH-208ENST00000481211 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 H7BY64 318 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 TM4SF5O14894 197 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 AZIN1O14977 448 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 DKK1O94907 266 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 CHRNGP07510 517 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 THRAP10827 490 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 MAGP20916 626 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 HMOX2P30519 316 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 AHRP35869 848 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 RPL14P50914 215 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ERVPABLB-1P60509 514 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 SH3BP2P78314 561 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 CATSPEREQ5SY80 951 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 TMTC4Q5T4D3 741 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 CACHD1Q5VU97 1274 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 RNF44Q7L0R7 432 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 ADCK2Q7Z695 626 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 SYVN1Q86TM6 617 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 LAS2Q8IYD9 372 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 KIAA2013Q8IYS2 634 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa12.52□□□□□ -0.41
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NISCH-208ENST00000481211 SORT1Q99523 831 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 MAP3K3Q99759 626 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 NUDT22Q9BRQ3 303 aa12.52□□□□□ -0.41
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NISCH-208ENST00000481211 SLC6A20Q9NP91 592 aa12.52□□□□□ -0.41
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NISCH-208ENST00000481211 PSD3Q9NYI0 1048 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 VTI1BQ9UEU0 232 aa12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 PCM1Q15154 2024 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 SERTM1A2A2V5 107 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 TCP11X1B4DZS4 312 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 TXNDC9O14530 226 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
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NISCH-208ENST00000481211 KANK2Q63ZY3 851 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 FRG2Q64ET8 278 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 LETMD1Q6P1Q0 360 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 FAM92BQ6ZTR7 304 aa12.51□□□□□ -0.41
NISCH-208ENST00000481211 USP53Q70EK8 1073 aa12.51□□□□□ -0.41
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