RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472863.5

HOXB3-207, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-207ENST00000472863 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 ETHE1O95571 254 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 G6PDP11413 515 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF33BQ06732 778 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 LAPTM5Q13571 262 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 ZFAND4Q86XD8 727 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 BRINP2Q9C0B6 783 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 PELI2Q9HAT8 420 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 PRM3Q9NNZ6 103 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 SPASTQ9UBP0 616 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXB3-207ENST00000472863 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 CCR8P51685 355 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 UFM1P61960 85 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 SF1Q15637 639 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 REPS1Q96D71 796 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 FEZF1A0PJY2 475 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 ISM1B1AKI9 464 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 ACADVLP49748 655 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.822e-9■■■□□ 16.8
HOXB3-207ENST00000472863 HERC3Q15034 1050 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 PLK5Q496M5 336 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 OR4K1Q8NGD4 311 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 ZFPM2Q8WW38 1151 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 CMTM7Q96FZ5 175 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 VPS29Q9UBQ0 182 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 DOLKQ9UPQ8 538 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 GYG2O15488 501 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 PRPH2P23942 346 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 RPS13P62277 151 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 GKN2Q86XP6 184 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 KRT78Q8N1N4 520 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 FBXL6Q8N531 539 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 OR2L3Q8NG85 312 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 BRF2Q9HAW0 419 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP26.43■■□□□ 1.822e-6■□□□□ 10.4
HOXB3-207ENST00000472863 UCKL1Q9NWZ5 548 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 AQP9O43315 295 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 NRP2O60462 931 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 EZRP15311 586 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 MNAT1P51948 309 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 MXRA7P84157 204 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 CUL3Q13618 768 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 SMU1Q2TAY7 513 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 CYP20A1Q6UW02 462 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 NELL1Q92832 810 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 AIF1LQ9BQI0 150 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 NPIPB8E9PQR5 432 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 AIM2O14862 343 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 CPOXP36551 454 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 CSNK1G2P78368 415 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 SLC25A3Q00325 362 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 HHEXQ03014 270 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 VN1R5Q7Z5H4 357 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 ADCK2Q7Z695 626 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 SLC9B2Q86UD5 537 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 ACTL8Q9H568 366 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 SLC6A20Q9NP91 592 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 KLHL20Q9Y2M5 609 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 SNX11Q9Y5W9 270 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 A0A1B0GTW7 788 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 OR6C74A6NCV1 312 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 TGFB1P01137 390 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 AMD1P17707 334 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 MAZP56270 477 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 GRIK2Q13002 908 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 TEAD4Q15561 434 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 DEFB133Q30KQ1 61 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 PLD3Q8IV08 490 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 LIX1Q8N485 282 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 ANKRD53Q8N9V6 530 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 PROKR1Q8TCW9 393 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 NUDT8Q8WV74 236 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 UBE2E3Q969T4 207 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 RCN3Q96D15 328 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 APOLD1Q96LR9 279 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 RTKNQ9BST9 563 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 DMRT3Q9NQL9 472 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 TTC28Q96AY4 2481 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-207ENST00000472863 SLC22A3O75751 556 aa26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms