RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470197.5

GCFC2-205, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 1 (best)

Gene GCFC2, Length 3,648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-205	ENST00000470197	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	CASC4	Q6P4E1	433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	EDA	Q92838	391 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	SFXN2	Q96NB2	322 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	EGFL8	Q99944	293 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	NTMT1	Q9BV86	223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	NAPB	Q9H115	298 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197		A0A1W2PP11	408 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	DENND3	A2RUS2	1198 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	C5orf60	A6NFR6	353 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197		F8WDY8	70 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	ATP9A	O75110	1047 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	JAK1	P23458	1154 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	DNAJB1	P25685	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	FAM166A	Q6J272	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	VSTM1	Q6UX27	236 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	TMEM26	Q6ZUK4	368 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	TRIM58	Q8NG06	486 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	MRI	Q9BWK5	157 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	PIGV	Q9NUD9	493 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	TNN	Q9UQP3	1299 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	STMND1	H3BQB6	276 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	RASGRF2	O14827	1237 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	INPPL1	O15357	1258 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	STBD1	O95210	358 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	SPP1	P10451	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	COG7	P83436	770 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	VEZF1	Q14119	521 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	UGCG	Q16739	394 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	RAB6C	Q53S08	254 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197		Q7L0L9	218 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	EXD1	Q8NHP7	514 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	CALHM2	Q9HA72	323 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	NOX4	Q9NPH5	578 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	ANKRD28	O15084	1053 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	FLRT2	O43155	660 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	SPAG6	O75602	509 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	CHRNG	P07510	517 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	ASNS	P08243	561 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	GPR89B	P0CG08	455 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	TAF1	P21675	1872 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	LAX1	Q8IWV1	398 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	KAT2B	Q92831	832 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	MAP4K1	Q92918	833 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	ZNF583	Q96ND8	569 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	ACTR8	Q9H981	624 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	CENPM	Q9NSP4	180 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	C2CD2	Q9Y426	696 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	PTPRC	P08575	1304 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	ZNF609	O15014	1411 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	RFXAP	O00287	272 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	CHAD	O15335	359 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	ACSL4	O60488	711 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	NDUFS7	O75251	213 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	KCNA5	P22460	613 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	CYP2F1	P24903	491 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	TACR3	P29371	465 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GCFC2-205	ENST00000470197	GDI1	P31150	447 aa		4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms