RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466636.1

SRPRB-202, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene SRPRB, Length 917 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-202ENST00000466636 BCKDHBP21953 392 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PSMB5P28074 263 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 NDUFS1P28331 727 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 DPP6P42658 865 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 CXCL12P48061 93 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 YBX1P67809 324 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 ZXDAP98168 799 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 REEP5Q00765 189 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 ART3Q13508 389 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 LAPTM5Q13571 262 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 KRT33BQ14525 404 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 TCEA2Q15560 299 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 VPS26BQ4G0F5 336 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PAGE2BQ5JRK9 111 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 WASHC2DQ5SRD0 308 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SLC30A9Q6PML9 568 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 VN1R5Q7Z5H4 357 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 C17orf64Q86WR6 236 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 LIX1Q8N485 282 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 RAB42Q8N4Z0 105 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 DEFB119Q8N690 84 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 MFSD2AQ8NA29 543 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 ABHD11Q8NFV4 315 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 HUS1BQ8NHY5 278 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SPDL1Q96EA4 605 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 KLHDC7BQ96G42 594 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 GSDMCQ9BYG8 508 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 TWSG1Q9GZX9 223 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 NT5DC2Q9H857 520 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 WDR41Q9HAD4 459 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 DMRT3Q9NQL9 472 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 MAP10Q9P2G4 905 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SLC7A8Q9UHI5 535 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 TMED5Q9Y3A6 229 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa9.19□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 A0A1W2PP18 115 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 DYTNA2CJ06 578 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 FXYD1O00168 92 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 GPR37L1O60883 481 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 EEDO75530 441 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PDE5AO76074 875 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PRPS2P11908 318 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SDC1P18827 310 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 MAPK1P28482 360 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SLC19A1P41440 591 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PIK3CBP42338 1070 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 MTTPP55157 894 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 CLDN8P56748 225 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 KCNK10P57789 538 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PSME3P61289 254 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 RPS13P62277 151 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 DMWDQ09019 674 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PTGR1Q14914 329 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 TLR1Q15399 786 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF423Q2M1K9 1284 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 MMEL1Q495T6 779 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 CACHD1Q5VU97 1274 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 ICE2Q659A1 982 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SLC36A4Q6YBV0 504 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 LAPTM4BQ86VI4 370 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 IQCHQ86VS3 1027 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PARGQ86W56 976 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PHACTR4Q8IZ21 702 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF740Q8NDX6 193 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 OR4K1Q8NGD4 311 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 OR2A1Q8NGT9 310 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 C1orf216Q8TAB5 229 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 WDR60Q8WVS4 1066 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 UBE2E3Q969T4 207 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 SH3KBP1Q96B97 665 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 ROPN1LQ96C74 230 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 APOLD1Q96LR9 279 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 ACAT2Q9BWD1 397 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 TAAR2Q9P1P5 351 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 VPS29Q9UBQ0 182 aa9.18□□□□□ -0.94
SRPRB-202ENST00000466636 PPT2Q9UMR5 302 aa9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms