RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456943.6

GMDS-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 2,308 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RPS13P62277 151 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 YBX1P67809 324 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PLIN5Q00G26 463 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FXNQ16595 210 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM124AQ86V42 546 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C17orf64Q86WR6 236 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SMPDL3AQ92484 453 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NELL1Q92832 810 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C12orf66Q96MD2 445 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 VAPAQ9P0L0 249 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PCM1Q15154 2024 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DFNA5O60443 496 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 UMPSP11172 480 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IDSP22304 550 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CXCR2P25025 360 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RPL10P27635 214 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KIAA1024LP59773 190 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PPP2CBP62714 309 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PPP2CAP67775 309 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CYP4F3Q08477 520 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PYCR3Q53H96 274 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LILRA2Q8N149 483 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CHTF18Q8WVB6 975 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SH3KBP1Q96B97 665 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FERD3LQ96RJ6 166 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BTBD1Q9H0C5 482 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PELI2Q9HAT8 420 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FZD3Q9NPG1 666 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PPT2Q9UMR5 302 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SUFUQ9UMX1 484 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SH2B3Q9UQQ2 575 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GPSM3Q9Y4H4 160 aa16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 REV3LO60673 3130 aa16.77■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LRATO95237 230 aa16.77■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PIK3CBP42338 1070 aa16.77■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LRIF1Q5T3J3 769 aa16.77■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TRIM69Q86WT6 500 aa16.77■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SLCO4A1Q96BD0 722 aa16.77■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GBP5Q96PP8 586 aa16.77■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DMRT3Q9NQL9 472 aa16.77■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ADGRE2Q9UHX3 823 aa16.77■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MMP17Q9ULZ9 603 aa16.77■□□□□ 0.28
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LRRC72A6NJI9 287 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FPGTO14772 594 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CDH1P12830 882 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 COX7A2P14406 83 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NDUFV2P19404 249 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HPCAL1P37235 193 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CTBSQ01459 385 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MTAPQ13126 283 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SFT2D3Q587I9 215 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RUNDC3AQ59EK9 446 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TBCELQ5QJ74 424 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IRGCQ6NXR0 463 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CANT1Q8WVQ1 401 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM3CQ92520 227 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EGLN2Q96KS0 407 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HHIPQ96QV1 700 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SIRT5Q9NXA8 310 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AURKCQ9UQB9 309 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KCNK6Q9Y257 313 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KDM1AO60341 852 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ETHE1O95571 254 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AQP4P55087 323 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SELPLGQ14242 412 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRT33BQ14525 404 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MTX3Q5HYI7 312 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CDC26Q8NHZ8 85 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NSMCE2Q96MF7 247 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BTBD9Q96Q07 612 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MYOCQ99972 504 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TAC3Q9UHF0 121 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CROCCQ5TZA2 2017 aa16.76■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa16.75■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RFXANKO14593 260 aa16.75■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MBTPS2O43462 519 aa16.75■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AKAP10O43572 662 aa16.75■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FUCA1P04066 466 aa16.75■□□□□ 0.27
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FCGR1AP12314 374 aa16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms