RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa14.82□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NUP210LQ5VU65 1888 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa14.81□□□□□ -0.04
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