RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 UGT3A2Q3SY77 523 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 PHF19Q5T6S3 580 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 CDCP2Q5VXM1 449 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 KANK2Q63ZY3 851 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 ATG16L1Q676U5 607 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 FCRL6Q6DN72 434 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 GRHL2Q6ISB3 625 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 IRGCQ6NXR0 463 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 NXPE4Q6UWF7 544 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 RNF44Q7L0R7 432 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 CUZD1Q86UP6 607 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 TRIM73Q86UV7 250 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 TAX1BP1Q86VP1 789 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 C17orf64Q86WR6 236 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 LAS2Q8IYD9 372 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 CCNYL1Q8N7R7 359 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 OR4D9Q8NGE8 314 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 TRPC4APQ8TEL6 797 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 STON2Q8WXE9 905 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC41A2Q96JW4 573 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 PPM1MQ96MI6 270 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF285Q96NJ3 590 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 PLCD4Q9BRC7 762 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 NUDT22Q9BRQ3 303 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 EFCAB11Q9BUY7 163 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC29A3Q9BZD2 475 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 SPNS1Q9H2V7 528 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 SEMA6CQ9H3T2 930 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 NT5DC2Q9H857 520 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 IPPKQ9H8X2 491 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 SYNPO2LQ9H987 977 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 C1GALT1Q9NS00 363 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 PILRAQ9UKJ1 303 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 PPT2Q9UMR5 302 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 BTRCQ9Y297 605 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 RAP2CQ9Y3L5 183 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 SPEGQ15772 3267 aa9.01□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 SERTM1A2A2V5 107 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 NPIPB8E9PQR5 432 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 H0YIV9 168 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF195O14628 629 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 NRP2O60462 931 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 CSO75390 466 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 RASSF9O75901 435 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 CLDN9O95484 217 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 ENO1P06733 434 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 CDH1P12830 882 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 MAGP20916 626 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 MPSTP25325 297 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 GSTM2P28161 218 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 CMPK1P30085 196 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 HNF4AP41235 474 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC1A6P48664 564 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 ARL4DP49703 201 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 CCR8P51685 355 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 INHBCP55103 352 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 FOXA1P55317 472 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 STX3Q13277 289 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 DOC2AQ14183 400 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 CFAP157Q5JU67 520 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 CATSPEREQ5SY80 951 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 NKAIN2Q5VXU1 208 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 LIPJQ5W064 366 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM71Q6P5X7 295 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 CYB5D1Q6P9G0 228 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 ERMP1Q7Z2K6 904 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 VN1R5Q7Z5H4 357 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 TMPRSS11BQ86T26 416 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 KMT5CQ86Y97 462 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 KIRREL3Q8IZU9 778 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 SNX31Q8N9S9 440 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 OR4F6Q8NGB9 312 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 WDR20Q8TBZ3 569 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 LRRC8CQ8TDW0 803 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 KLHL6Q8WZ60 621 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 USP7Q93009 1102 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 ZUFSPQ96AP4 578 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 SEC16BQ96JE7 1060 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP4-207ENST00000454947 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms