RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433274.6

SF1-209, Transcript of splicing factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SF1, Length 2,317 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1-209ENST00000433274 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.61□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 ERGP11308 486 aa14.61□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 ARHGAP19Q14CB8 494 aa14.61□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 CLCA4Q14CN2 919 aa14.61□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 SPATS1Q496A3 300 aa14.61□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 PGBD3Q8N328 593 aa14.61□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 OR2T34Q8NGX1 318 aa14.61□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 ASB12Q8WXK4 309 aa14.61□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 HAUS8Q9BT25 410 aa14.61□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa14.61□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 OR52A4PA6NMU1 304 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 ZNF839A8K0R7 811 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 FPGTO14772 594 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 ARPC2O15144 300 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 MYO1DO94832 1006 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 B3GALT4O96024 378 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 IDSP22304 550 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 PSMB5P28074 263 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 ENPP7Q6UWV6 458 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 PRR23BQ6ZRT6 265 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 ANKRD46Q86W74 232 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 RIMKLAQ8IXN7 391 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 LAS2Q8IYD9 372 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 LILRA2Q8N149 483 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 TESCQ96BS2 214 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 PDXPQ96GD0 296 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 PKP2Q99959 881 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 MENTQ9BUN1 341 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 PRDM8Q9NQV8 689 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 AP4S1Q9Y587 144 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 LRRC72A6NJI9 287 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 TGFB1P01137 390 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 NCK1P16333 377 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 PRPS1L1P21108 318 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 ATP6V1C1P21283 382 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 HSD17B2P37059 387 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 KRT33BQ14525 404 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 CYP2A13Q16696 494 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 GTDC1Q4AE62 458 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 RD3Q7Z3Z2 195 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 C17orf64Q86WR6 236 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 TRIM69Q86WT6 500 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 ZUFSPQ96AP4 578 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 TRIM15Q9C019 465 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 XKR8Q9H6D3 395 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 DMRT3Q9NQL9 472 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 ACTR3BQ9P1U1 418 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 RIMS3Q9UJD0 308 aa14.6□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 SAP18O00422 153 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 C7P10643 843 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 ACADSP16219 412 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 RAE1P78406 368 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 LAPTM5Q13571 262 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 GRAMD1BQ3KR37 738 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 SPIN4Q56A73 249 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 TPRG1LQ5T0D9 272 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 OR4F3Q6IEY1 312 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 LCN8Q6JVE9 175 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 GPR180Q86V85 440 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 OR7A2PQ8NGA2 310 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 CHTF18Q8WVB6 975 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 OR1E3Q8WZA6 343 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 SMPDL3AQ92484 453 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 SLCO4A1Q96BD0 722 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 CAMK1GQ96NX5 476 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 OR2M4Q96R27 311 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 KLHL4Q9C0H6 718 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 VCX3BQ9H321 246 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 OR51B5Q9H339 312 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 SLC6A13Q9NSD5 602 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 SPATA7Q9P0W8 599 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 EBF1Q9UH73 591 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 SNX13Q9Y5W8 968 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 TRIOO75962 3097 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 PRR19A6NJB7 356 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 SRFP11831 508 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 OR4D2P58180 307 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 KIAA1024LP59773 190 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 NFATC4Q14934 902 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 MSRB3Q8IXL7 192 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 LINC01555Q8NAE3 123 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 DENND6BQ8NEG7 585 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 OR8J3Q8NGG0 315 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 CANT1Q8WVQ1 401 aa14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SF1-209ENST00000433274 BMFQ96LC9 184 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms