RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 RTP2Q5QGT7 225 aa16.34■□□□□ 0.21
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HCLS1-202ENST00000428394 CEP68Q76N32 757 aa16.34■□□□□ 0.21
HCLS1-202ENST00000428394 RNF180Q86T96 592 aa16.34■□□□□ 0.21
HCLS1-202ENST00000428394 RASGRP3Q8IV61 690 aa16.34■□□□□ 0.21
HCLS1-202ENST00000428394 P3H2Q8IVL5 708 aa16.34■□□□□ 0.21
HCLS1-202ENST00000428394 MCFD2Q8NI22 146 aa16.34■□□□□ 0.21
HCLS1-202ENST00000428394 CRELD1Q96HD1 420 aa16.34■□□□□ 0.21
HCLS1-202ENST00000428394 CASD1Q96PB1 797 aa16.34■□□□□ 0.21
HCLS1-202ENST00000428394 COPS8Q99627 209 aa16.34■□□□□ 0.21
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HCLS1-202ENST00000428394 RNF186Q9NXI6 227 aa16.34■□□□□ 0.21
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HCLS1-202ENST00000428394 ABCG2Q9UNQ0 655 aa16.34■□□□□ 0.21
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HCLS1-202ENST00000428394 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
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HCLS1-202ENST00000428394 ATG16L2Q8NAA4 619 aa16.34■□□□□ 0.21
HCLS1-202ENST00000428394 DENND6BQ8NEG7 585 aa16.34■□□□□ 0.21
HCLS1-202ENST00000428394 ASB11Q8WXH4 323 aa16.34■□□□□ 0.21
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HCLS1-202ENST00000428394 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa16.33■□□□□ 0.2
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HCLS1-202ENST00000428394 ETV6P41212 452 aa16.33■□□□□ 0.2
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HCLS1-202ENST00000428394 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
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HCLS1-202ENST00000428394 SYT12Q8IV01 421 aa16.33■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 ATL1Q8WXF7 558 aa16.33■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 TSSK3Q96PN8 268 aa16.33■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 DCSTAMPQ9H295 470 aa16.33■□□□□ 0.2
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HCLS1-202ENST00000428394 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa16.33■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 MAFFQ9ULX9 164 aa16.33■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 POFUT2Q9Y2G5 429 aa16.33■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 U3KQV3 271 aa16.33■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 AGAP5A6NIR3 686 aa16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 SUV39H1O43463 412 aa16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 MPZL2O60487 215 aa16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 WBP4O75554 376 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 AP2A2O94973 939 aa16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 PRAMEF12O95522 483 aa16.32■□□□□ 0.2
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HCLS1-202ENST00000428394 ALPIP09923 528 aa16.32■□□□□ 0.2
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HCLS1-202ENST00000428394 HNF4AP41235 474 aa16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 CDKN2CP42773 168 aa16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 MAP2K4P45985 399 aa16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
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HCLS1-202ENST00000428394 RPP38P78345 283 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 CDH18Q13634 790 aa16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 VEPH1Q14D04 833 aa16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 PERM1Q5SV97 790 aa16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 ANKRD34AQ69YU3 496 aa16.32■□□□□ 0.2
HCLS1-202ENST00000428394 LINGO4Q6UY18 593 aa16.32■□□□□ 0.2
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