RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423327.2

SPC24-201, Transcript of SPC24, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SPC24, Length 840 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24-201ENST00000423327 FOXS1O43638 330 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 C1QAP02745 245 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 STATHP02808 62 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 EZRP15311 586 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 MMP11P24347 488 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 RGS4P49798 205 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 ABATP80404 500 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 FOXK1P85037 733 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 MGAT5Q09328 741 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 ZNF460Q14592 562 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 FAM214AQ32MH5 1076 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 DUPD1Q68J44 220 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 FAM45BPQ6NSW5 357 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 AGTRAPQ6RW13 159 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 SYT10Q6XYQ8 523 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 VN1R4Q7Z5H5 301 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 ZBED8Q8IZ13 594 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 CSNK1A1LQ8N752 337 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 AMER3Q8N944 861 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 TEX19Q8NA77 164 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 FAM45AQ8TCE6 357 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 CCDC138Q96M89 665 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 PRAP1Q96NZ9 151 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 ERP44Q9BS26 406 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 SGPP1Q9BX95 441 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 ATG10Q9H0Y0 220 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 CLMPQ9H6B4 373 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 PARVBQ9HBI1 364 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 VWA7Q9Y334 891 aa14.74□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 AGPSO00116 658 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 SLC16A5O15375 505 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 CD63P08962 238 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 CD97P48960 835 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 EFNA3P52797 238 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 EMP3P54852 163 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 RRADP55042 308 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 MLLT10P55197 1068 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 CSNK1G2P78368 415 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 RELAQ04206 551 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 NAE1Q13564 534 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 TRADDQ15628 312 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 PPP1R3AQ16821 1122 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 MUM1Q2TAK8 710 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 SBSNQ6UWP8 590 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 CAPN12Q6ZSI9 719 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 ADCK2Q7Z695 626 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 STRA8Q7Z7C7 330 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 MCOLN3Q8TDD5 553 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 MIB2Q96AX9 1013 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 CABS1Q96KC9 395 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 IP6K3Q96PC2 410 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 ZNF304Q9HCX3 659 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 GPR83Q9NYM4 423 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 WHRNQ9P202 907 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 ZFATQ9P243 1243 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 FBXL4Q9UKA2 621 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 PLAAQ9Y263 795 aa14.73□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 FLNCQ14315 2725 aa14.72□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa14.72□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 CASQ1P31415 396 aa14.72□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 IL2P60568 153 aa14.72□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 KCNC4Q03721 635 aa14.72□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 KLC1Q07866 573 aa14.72□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 VWA2Q5GFL6 755 aa14.72□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 PRMT9Q6P2P2 845 aa14.72□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 KIRREL2Q6UWL6 708 aa14.72□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 PRSS41Q7RTY9 318 aa14.72□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 CEP97Q8IW35 865 aa14.72□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 PRSS58Q8IYP2 241 aa14.72□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 GALNT16Q8N428 558 aa14.72□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 Q8NA96 180 aa14.72□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 STT3BQ8TCJ2 826 aa14.72□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 PYCR2Q96C36 320 aa14.72□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 OR4K3Q96R72 315 aa14.72□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa14.72□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 FEZF1A0PJY2 475 aa14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 ZGLP1P0C6A0 271 aa14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 CDH1P12830 882 aa14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 NPPBP16860 134 aa14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 FBLP22087 321 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 SSTR1P30872 391 aa14.71□□□□□ -0.05
SPC24-201ENST00000423327 BCL6P41182 706 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms