RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MRFAP1Q9Y605 127 aa15.62■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1B0GTH9 108 aa15.61■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR2A25A4D2G3 310 aa15.61■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM171A2A8MVW0 826 aa15.61■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H0YGG7 62 aa15.61■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NME2P1O60361 137 aa15.61■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC25A12O75746 678 aa15.61■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NME2P22392 152 aa15.61■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTGER1P34995 402 aa15.61■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSPA14Q0VDF9 509 aa15.61■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNFT1Q5M7Z0 435 aa15.61■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KAZNQ674X7 775 aa15.61■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLEC9AQ6UXN8 241 aa15.61■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CSNK1A1LQ8N752 337 aa15.61■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AMER2Q8N7J2 671 aa15.61■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HMGCLL1Q8TB92 370 aa15.61■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAD51AP1Q96B01 352 aa15.61■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ALS2CR12Q96Q35 445 aa15.61■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYTH2Q99418 400 aa15.61■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBL1YQ9BQ87 522 aa15.61■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DRC3Q9H069 523 aa15.61■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MMP25Q9NPA2 562 aa15.61■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NENFQ9UMX5 172 aa15.61■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa15.6■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1B0GTH6 734 aa15.6■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TXNDC9O14530 226 aa15.6■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TFECO14948 347 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRMT3O60678 531 aa15.6■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 INHBBP09529 407 aa15.6■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSMB5P28074 263 aa15.6■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AGTR2P50052 363 aa15.6■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TAS2R50P59544 299 aa15.6■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZBED6P86452 979 aa15.6■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DENND5AQ6IQ26 1287 aa15.6■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBXO42Q6P3S6 717 aa15.6■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ACRBPQ8NEB7 543 aa15.6■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR2A1Q8NGT9 310 aa15.6■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STYXQ8WUJ0 223 aa15.6■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUDT8Q8WV74 236 aa15.6■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARSGQ96EG1 525 aa15.6■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SEC16BQ96JE7 1060 aa15.6■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TTC1Q99614 292 aa15.6■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NPAS2Q99743 824 aa15.6■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMR3AQ99954 134 aa15.6■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VN1R1Q9GZP7 353 aa15.6■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 L3MBTL1Q9Y468 752 aa15.6■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ALG6Q9Y672 507 aa15.6■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 JMJD1CQ15652 2540 aa15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 I3L1I5 382 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPC4O75487 556 aa15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 APOA4P06727 396 aa15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HEXAP06865 529 aa15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM253P0C7T8 217 aa15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSMB4P28070 264 aa15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CMPK1P30085 196 aa15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCR7P32248 378 aa15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC1A1P43005 524 aa15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EFNA3P52797 238 aa15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PMPCAQ10713 525 aa15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM53BQ14153 422 aa15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SYT16Q17RD7 645 aa15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MFSD4BQ5TF39 518 aa15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM198Q66K66 360 aa15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRC8BQ6P9F7 803 aa15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LANCL3Q6ZV70 420 aa15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRIMA1Q86XR5 153 aa15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VRK3Q8IV63 474 aa15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC35G2Q8TBE7 412 aa15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM125Q96AQ2 219 aa15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DPH7Q9BTV6 452 aa15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PACSIN1Q9BY11 444 aa15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RASSF1Q9NS23 344 aa15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HRH3Q9Y5N1 445 aa15.59■□□□□ 0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SOWAHDA6NJG2 315 aa15.58■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FOXS1O43638 330 aa15.58■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NRP2O60462 931 aa15.58■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STK10O94804 968 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TNNT1P13805 278 aa15.58■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MSNP26038 577 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RBL1P28749 1068 aa15.58■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PEX19P40855 299 aa15.58■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AVPR1BP47901 424 aa15.58■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TYRO3Q06418 890 aa15.58■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NDUFA9Q16795 377 aa15.58■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HKDC1Q2TB90 917 aa15.58■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MINDY4Q4G0A6 757 aa15.58■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa15.58■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZZZ3Q8IYH5 903 aa15.58■□□□□ 0.08
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GSDMBQ8TAX9 411 aa15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms