RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419593.5

SYS1-DBNDD2-201, Transcript of SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene SYS1-DBNDD2, Length 1,313 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP15.8■□□□□ 0.12
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SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 PLAGL1Q9UM63 463 aa15.77■□□□□ 0.12
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SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 SOCS6O14544 535 aa15.76■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 SPAG7O75391 227 aa15.76■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 PRF1P14222 555 aa15.76■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ITGAXP20702 1163 aa15.76■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ADRA1DP25100 572 aa15.76■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 CNTFP26441 200 aa15.76■□□□□ 0.11
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 CCNFP41002 786 aa15.76■□□□□ 0.11
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