RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 A0A1W2PQF6 199 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 DHRS12A0PJE2 317 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 PIPSLA2A3N6 862 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 TBC1D3LB9A6J9 549 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 ARPC2O15144 300 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 ADAM23O75077 832 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 TBC1D3HP0C7X1 549 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 ERGP11308 486 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 PCNAP12004 261 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 FCGR1AP12314 374 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 NPPBP16860 134 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 ATP6V1B2P21281 511 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 CXCR2P25025 360 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 KIR3DL1P43629 444 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 HSPA13P48723 471 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 DGKQP52824 942 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 LRRC74AQ0VAA2 488 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 FXNQ16595 210 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 CYP2A13Q16696 494 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 SLC44A4Q53GD3 710 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 RABL3Q5HYI8 236 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 IRGCQ6NXR0 463 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 CYP2R1Q6VVX0 501 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 RNF111Q6ZNA4 994 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 GPR180Q86V85 440 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 LAS2Q8IYD9 372 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 KRT78Q8N1N4 520 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 GTF2H4Q92759 462 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 NELL1Q92832 810 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 APIPQ96GX9 242 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 SLC45A3Q96JT2 553 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 PPM1MQ96MI6 270 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 TSSK3Q96PN8 268 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 BTBD9Q96Q07 612 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 Q9H521 79 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 BATF3Q9NR55 127 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 ARMC1Q9NVT9 282 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 CIDEBQ9UHD4 219 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 ADGRE2Q9UHX3 823 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 PPT2Q9UMR5 302 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 PRKAB1Q9Y478 270 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 OR1A2Q9Y585 309 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 F5P12259 2224 aa10.75□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 A0A096LPI6 279 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 PRR23AA6NEV1 266 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 IDSP22304 550 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 SERPINB1P30740 379 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 HPCAL1P37235 193 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 RPL3P39023 403 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 PIK3CBP42338 1070 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 CTBSQ01459 385 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 KLC1Q07866 573 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 LRIF1Q5T3J3 769 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 LPCAT4Q643R3 524 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 NXPE4Q6UWF7 544 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 IFNEQ86WN2 208 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 C17orf64Q86WR6 236 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 KBTBD2Q8IY47 623 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 OR5AR1Q8NGP9 310 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 CLHC1Q8NHS4 586 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 HUS1BQ8NHY5 278 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 SMPDL3AQ92484 453 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 CXorf40BQ96DE9 158 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 GBP5Q96PP8 586 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 PELI2Q9HAT8 420 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 SIRT5Q9NXA8 310 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 SLAMF8Q9P0V8 285 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 EGFL7Q9UHF1 273 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 CDH23Q9H251 3354 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 BRWD1Q9NSI6 2320 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 LRRC72A6NJI9 287 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 MAGEB17A8MXT2 336 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 C2CD4DB7Z1M9 353 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 ACP5P13686 325 aa10.74□□□□□ -0.69
CTXN3-202ENST00000395322 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms