RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 PEX12O00623 359 aa19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 PIAS1O75925 651 aa19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 CASRP41180 1078 aa19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 PGDP52209 483 aa19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 RELAQ04206 551 aa19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 TLE1Q04724 770 aa19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 KLRB1Q12918 225 aa19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 NAE1Q13564 534 aa19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 HKDC1Q2TB90 917 aa19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM207Q6UWW9 146 aa19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 COL26A1Q96A83 441 aa19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 PCBD2Q9H0N5 130 aa19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 RAB17Q9H0T7 212 aa19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 EPN3Q9H201 632 aa19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC26A1Q9H2B4 701 aa19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF304Q9HCX3 659 aa19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 SMYD2Q9NRG4 433 aa19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 P4HTMQ9NXG6 502 aa19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 SH2B3Q9UQQ2 575 aa19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 NUP210LQ5VU65 1888 aa19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 A6NL46 340 aa19.29■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 CEACAM4O75871 244 aa19.29■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 EMP3P54852 163 aa19.29■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 PLTPP55058 493 aa19.29■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 PRMT9Q6P2P2 845 aa19.29■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa19.29■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 TEX19Q8NA77 164 aa19.29■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 FDCSPQ8NFU4 85 aa19.29■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa19.29■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 SPSB2Q99619 263 aa19.29■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM54Q9BYV2 358 aa19.29■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 RHOJQ9H4E5 214 aa19.29■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 MLXIPLQ9NP71 852 aa19.29■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM184CQ9NVA4 438 aa19.29■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 ARL15Q9NXU5 204 aa19.29■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 IKZF3Q9UKT9 509 aa19.29■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 CCND1P24385 295 aa19.28■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 HRH2P25021 359 aa19.28■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 AP1S2P56377 157 aa19.28■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 TAS2R39P59534 338 aa19.28■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 CAV1Q03135 178 aa19.28■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF460Q14592 562 aa19.28■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 TRADDQ15628 312 aa19.28■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 C17orf64Q86WR6 236 aa19.28■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 VPS39Q96JC1 886 aa19.28■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 SGPP1Q9BX95 441 aa19.28■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 CDC23Q9UJX2 597 aa19.28■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 VSTM2BA6NLU5 285 aa19.27■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 TXNDC9O14530 226 aa19.27■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 P2RX6O15547 441 aa19.27■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 GUCA1CO95843 209 aa19.27■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 IGHEP01854 428 aa19.27■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 STATHP02808 62 aa19.27■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 FBLP22087 321 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 MMP11P24347 488 aa19.27■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 CSNK1G2P78368 415 aa19.27■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 RAPSNQ13702 412 aa19.27■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 DCAF10Q5QP82 559 aa19.27■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 LCTLQ6UWM7 567 aa19.27■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC25Q86WR0 208 aa19.27■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 FBXO25Q8TCJ0 367 aa19.27■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 CDKL2Q92772 493 aa19.27■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 MCMBPQ9BTE3 642 aa19.27■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 NUDT9Q9BW91 350 aa19.27■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR83Q9NYM4 423 aa19.27■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 CDC14AQ9UNH5 594 aa19.27■□□□□ 0.68
ANKRD39-201ENST00000393537 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa19.26■□□□□ 0.67
ANKRD39-201ENST00000393537 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa19.26■□□□□ 0.67
ANKRD39-201ENST00000393537 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
ANKRD39-201ENST00000393537 MASP2O00187 686 aa19.26■□□□□ 0.67
ANKRD39-201ENST00000393537 CDC7O00311 574 aa19.26■□□□□ 0.67
ANKRD39-201ENST00000393537 URI1O94763 535 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
ANKRD39-201ENST00000393537 WISP1O95388 367 aa19.26■□□□□ 0.67
ANKRD39-201ENST00000393537 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
ANKRD39-201ENST00000393537 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
ANKRD39-201ENST00000393537 CDH1P12830 882 aa19.26■□□□□ 0.67
ANKRD39-201ENST00000393537 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
ANKRD39-201ENST00000393537 OCA2Q04671 838 aa19.26■□□□□ 0.67
ANKRD39-201ENST00000393537 GARNL3Q5VVW2 1013 aa19.26■□□□□ 0.67
ANKRD39-201ENST00000393537 SBSNQ6UWP8 590 aa19.26■□□□□ 0.67
ANKRD39-201ENST00000393537 ZDHHC24Q6UX98 284 aa19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms