RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 KLK8O60259 260 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MAFKO60675 156 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 DPM1O60762 260 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 FAM20BO75063 409 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PMPCBO75439 489 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ERN1O75460 977 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CPEP16870 476 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 HLA-DPA1P20036 260 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 BDNFP23560 247 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RRM2P31350 389 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CTSKP43235 329 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 UFM1P61960 85 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 IFITM2Q01629 132 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SEMA3AQ14563 771 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RAB41Q5JT25 222 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 C6orf136Q5SQH8 315 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CCNJQ5T5M9 372 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 WSCD1Q658N2 575 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 DLEU7Q6UYE1 221 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 USP53Q70EK8 1073 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 KDELC2Q7Z4H8 507 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 DEFB128Q7Z7B8 93 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD49Q8WVL7 239 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SLC13A3Q8WWT9 602 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 FIG4Q92562 907 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 USP7Q93009 1102 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PGLYRP2Q96PD5 576 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 GON7Q9BXV9 100 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MCOLN1Q9GZU1 580 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 NUAK2Q9H093 628 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RACGAP1Q9H0H5 632 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 DYRK4Q9NR20 520 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 OSER1Q9NX31 292 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TBC1D14Q9P2M4 693 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ENOPH1Q9UHY7 261 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa6.99□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 DNAH12Q6ZR08 3092 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 OR2A25A4D2G3 310 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 WASH4PA8MWX3 477 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGEF9O43307 516 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 UGT2B17O75795 530 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGEF15O94989 841 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 EPOP01588 193 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 FGF1P05230 155 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SERPINF2P08697 491 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 F7P08709 466 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CHRNB1P11230 501 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 NAT2P11245 290 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PCNAP12004 261 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ITGA2P17301 1181 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 NUDT1P36639 197 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PIGAP37287 484 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MAGEA2P43356 314 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 OR1G1P47890 313 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 UGT2B15P54855 530 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CDKN2DP55273 166 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 OR2B6P58173 313 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TSPY1Q01534 308 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CYP4F3Q08477 520 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RBBP7Q16576 425 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 MAPKAPK3Q16644 382 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PYCR3Q53H96 274 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 ARMCX4Q5H9R4 360 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 KDELC1Q6UW63 502 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CDH24Q86UP0 819 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 P3H2Q8IVL5 708 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 OR52K2Q8NGK3 314 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 SUN5Q8TC36 379 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa6.98□□□□□ -1.29
CTPS1-201ENST00000372616 PTERQ96BW5 349 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.5 ms