RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAJB5O75953 348 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 TUBB4AP04350 444 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 GP5P40197 560 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 GUCY2DQ02846 1103 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHAF1BQ13112 559 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAE1Q13564 534 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM214AQ32MH5 1076 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLD3Q8IV08 490 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2Y1Q8NGV0 311 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD49Q8WVL7 239 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABHD17AQ96GS6 310 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRAP1Q96NZ9 151 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCBD2Q9H0N5 130 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAB39LQ9H9S4 337 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUP210LQ5VU65 1888 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDC7O00311 574 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 P2RX6O15547 441 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCND1P24385 295 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOLR3P41439 243 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 POU4F1Q01851 419 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 HKDC1Q2TB90 917 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 LCTLQ6UWM7 567 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB43Q86YS6 212 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSNK1A1LQ8N752 337 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR56A3Q8NH54 315 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD7Q92527 254 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXL8Q96CD0 374 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR22Q99680 433 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM54Q9BYV2 358 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPAMQ9HCL2 828 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM184CQ9NVA4 438 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 TXNDC16Q9P2K2 825 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 BAHCC1Q9P281 2608 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 GUCA1CO95843 209 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 UMODP07911 640 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD63P08962 238 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 HRH2P25021 359 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 OTX2P32243 289 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 STX2P32856 288 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR1D4P47884 311 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 EMP3P54852 163 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSNK1G2P78368 415 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP1A4Q13733 1029 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 MUM1Q2TAK8 710 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 OVCH1Q7RTY7 1134 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRGPREQ86SM8 312 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 C17orf64Q86WR6 236 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTAGE3PQ8IX95 158 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 MNS1Q8NEH6 495 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBF1Q8TES7 1133 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 PYCR2Q96C36 320 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 CABS1Q96KC9 395 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPSB2Q99619 263 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC26A1Q9H2B4 701 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR54Q9H977 334 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTSFQ9UBX1 484 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 TLK1Q9UKI8 766 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTAGE15A4D2H0 777 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALBP02768 609 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTAGE8P0CG41 777 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLA2G2AP14555 144 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPPBP16860 134 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC12A2P55011 1212 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 NKG7Q16617 165 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 VN1R4Q7Z5H5 301 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF605Q86T29 641 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTAGE6Q86UF2 777 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTAGE4Q8IX94 777 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPM1NQ8N819 430 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATL1Q8WXF7 558 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPAN17Q96FV3 270 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4K3Q96R72 315 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 ING2Q9H160 280 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAU2Q9Y6X3 613 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 MKRN2OSH3BPM6 223 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 K7EM74 188 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM155BO75949 473 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDH1P12830 882 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 NR1D1P20393 614 aa18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms