RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000276410.6

CHRNA6-201, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 6 subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHRNA6, Length 2,400 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6-201ENST00000276410 OR51E2Q9H255 320 aa9.64□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 EHD1Q9H4M9 534 aa9.64□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 RAD18Q9NS91 495 aa9.64□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa9.64□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa9.64□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 TMED5Q9Y3A6 229 aa9.64□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa9.64□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 A0A1B0GVM2 712 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 CLDN11O75508 207 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 CCNDBP1O95273 360 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 KCNK5O95279 499 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 CLDN9O95484 217 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 OPN1SWP03999 348 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 SEMG1P04279 462 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 ADRA2AP08913 450 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 EBLN1P0CF75 366 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 ACPPP15309 386 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
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CHRNA6-201ENST00000276410 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
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CHRNA6-201ENST00000276410 ZNF404Q494X3 552 aa9.63□□□□□ -0.87
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CHRNA6-201ENST00000276410 ADNP2Q6IQ32 1131 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 KIAA1841Q6NSI8 718 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 ZNF621Q6ZSS3 439 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 DEFB128Q7Z7B8 93 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 AKAP14Q86UN6 197 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 HEATR4Q86WZ0 1026 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 NPAS4Q8IUM7 802 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 STK40Q8N2I9 435 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 PANX1Q96RD7 426 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 COPS4Q9BT78 406 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 NTMT1Q9BV86 223 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 ITPAQ9BY32 194 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 RLIMQ9NVW2 624 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 GPR83Q9NYM4 423 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 TRPS1Q9UHF7 1281 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 AGAP5A6NIR3 686 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 H7C4K7 107 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 CLIC1O00299 241 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 FPGTO14772 594 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 SNPHO15079 494 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 TBL1XO60907 577 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 INHAP05111 366 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 ZNF24P17028 368 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 BPIP17213 487 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 ALOX12P18054 663 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 DGKAP23743 735 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 KDELR2P33947 212 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 GRK3P35626 688 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 HMGCLP35914 325 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 PCYT1AP49585 367 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 VMACQ2NL98 169 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 C5orf22Q49AR2 442 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 NEK5Q6P3R8 708 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 SVOPQ8N4V2 548 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 OR52J3Q8NH60 311 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 SLC38A4Q969I6 547 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 MYO19Q96H55 970 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 SLC22A12Q96S37 553 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 CLSTN3Q9BQT9 956 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 CENPOQ9BU64 300 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 CDADC1Q9BWV3 514 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 TTLL2Q9BWV7 592 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 BBS2Q9BXC9 721 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 VN1R3Q9BXE9 311 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 ROGDIQ9GZN7 287 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 ELOVL6Q9H5J4 265 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 WDR70Q9NW82 654 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 ARL15Q9NXU5 204 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 FAM8A1Q9UBU6 413 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 SRRDQ9UH36 339 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 BTBD3Q9Y2F9 522 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 TESMINQ9Y4I5 508 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa9.63□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 ILVBLA1L0T0 632 aa9.62□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 TLL1O43897 1013 aa9.62□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 FZD6O60353 706 aa9.62□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 PTHP01270 115 aa9.62□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 STSP08842 583 aa9.62□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 HSMCR30P0CW71 290 aa9.62□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 PPP3CCP48454 512 aa9.62□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 ARHGDIAP52565 204 aa9.62□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 UGT8Q16880 541 aa9.62□□□□□ -0.87
CHRNA6-201ENST00000276410 TIGD6Q17RP2 521 aa9.62□□□□□ -0.87
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