RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 SNX4O95219 450 aa10.53□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 EPHB3P54753 998 aa10.53□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 SLC10A7Q0GE19 358 aa10.53□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 PXDC1Q5TGL8 231 aa10.53□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 LAIR1Q6GTX8 287 aa10.53□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 FAM131AQ6UXB0 335 aa10.53□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 DLEU7Q6UYE1 221 aa10.53□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa10.53□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 CRYBG2Q8N1P7 616 aa10.53□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 LRRC52Q8N7C0 313 aa10.53□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 DTX3Q8N9I9 347 aa10.53□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 OR8H1Q8NGG4 311 aa10.53□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 TMCO6Q96DC7 493 aa10.53□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF599Q96NL3 588 aa10.53□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 DUSP21Q9H596 190 aa10.53□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa10.53□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 GPR83Q9NYM4 423 aa10.53□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 MSRAQ9UJ68 235 aa10.53□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 MKLN1Q9UL63 735 aa10.53□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 ACTL7AQ9Y615 435 aa10.53□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 HOXA2O43364 376 aa10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 PAGE1O75459 146 aa10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 SCELO95171 688 aa10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 MLYCDO95822 493 aa10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 CD6P30203 668 aa10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 RYKP34925 604 aa10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 PTGS2P35354 604 aa10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 RPS24P62847 133 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 MVKQ03426 396 aa10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 FAM187BQ17R55 369 aa10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 BTBD16Q32M84 506 aa10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 CARD16Q5EG05 197 aa10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 BRMS1LQ5PSV4 323 aa10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 OR2T5Q6IEZ7 315 aa10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF605Q86T29 641 aa10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 OR2T29Q8NH02 315 aa10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 SPPL2AQ8TCT8 520 aa10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 DNASE1L2Q92874 299 aa10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 IGSF21Q96ID5 467 aa10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 UCK2Q9BZX2 261 aa10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 NMUR1Q9HB89 426 aa10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 FBXL12Q9NXK8 326 aa10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 VNN3Q9NY84 501 aa10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 MALT1Q9UDY8 824 aa10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 ABCG2Q9UNQ0 655 aa10.52□□□□□ -0.72
CNGA3-201ENST00000272602 C2orf78A6NCI8 922 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 J3KR12 359 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 TSPAN4O14817 238 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 IL7P13232 177 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 TSTQ16762 297 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 SLX4IPQ5VYV7 408 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 KLHL17Q6TDP4 642 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 PRSS48Q7RTY5 328 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 UBQLNLQ8IYU4 475 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 AADATQ8N5Z0 425 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 LRRC20Q8TCA0 184 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF675Q8TD23 568 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 TSPEARQ8WU66 669 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 PHF21AQ96BD5 680 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 LINGO1Q96FE5 620 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 SAGE1Q9NXZ1 904 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 DUSP12Q9UNI6 340 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 CACNA1GO43497 2377 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 ERVH48-1M5A8F1 160 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 SLC7A4O43246 635 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 NIPSNAP2O75323 286 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 CYP2A7P20853 494 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 RRM2P31350 389 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 OR3A3P47888 321 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 DAPP51397 102 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 TBX4P57082 545 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 CHRNEQ04844 493 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 ZMAT1Q5H9K5 638 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 TUBA3EQ6PEY2 450 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 Q7L0L9 218 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 LIX1Q8N485 282 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 LINC01465Q8N7H1 131 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 KREMEN2Q8NCW0 462 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 MYDGFQ969H8 173 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 NTAN1Q96AB6 310 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 PYURFQ96I23 114 aa10.52□□□□□ -0.73
CNGA3-201ENST00000272602 SLC9A7Q96T83 725 aa10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms