RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268638.9

IRF8-201, Transcript of interferon regulatory factor 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IRF8, Length 3,030 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8-201ENST00000268638 HS6ST1O60243 411 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 SCN2BO60939 215 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 AP2A2O94973 939 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 MAPK1P28482 360 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 PRLHRP49683 370 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 PIGFQ07326 219 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 KCTD8Q6ZWB6 473 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 VTCN1Q7Z7D3 282 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 SYTL1Q8IYJ3 562 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 MMP20O60882 483 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 SOD1P00441 154 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 CATP04040 527 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 NTRK1P04629 796 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 NUDT7P0C024 238 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 DCTP40126 519 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 CDK9P50750 372 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 ST8SIA6P61647 398 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 STARD3Q14849 445 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 GPR107Q5VW38 600 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 LIPJQ5W064 366 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 ERAP2Q6P179 960 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 TTC23LQ6PF05 361 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 CRTC3Q6UUV7 619 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 HUS1BQ8NHY5 278 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 MBOAT4Q96T53 435 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 C8orf4Q9NR00 106 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 ABCG2Q9UNQ0 655 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 TMED5Q9Y3A6 229 aa14.66□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 H3BM21 787 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 hCG_2039718K7EN88 272 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 MITFO75030 526 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 XYLBO75191 536 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 PRPS1L1P21108 318 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 PRPH2P23942 346 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 ESRRGP62508 458 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 KCNAB2Q13303 367 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 MEP1AQ16819 746 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 LDLRAP1Q5SW96 308 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 IER5LQ5T953 404 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 NEK10Q6ZWH5 1172 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 GALNT5Q7Z7M9 940 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 RASGRP3Q8IV61 690 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 OR7G3Q8NG95 312 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 NELL1Q92832 810 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 CCDC138Q96M89 665 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 OSBPL10Q9BXB5 764 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 FAM118AQ9NWS6 357 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 MARK1Q9P0L2 795 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 TSPAN11A1L157 253 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 TRIM64A6NGJ6 449 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 RETP07949 1114 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 AQP1P29972 269 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 PPP2R2BQ00005 443 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 IL1RL1Q01638 556 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 GTF2H3Q13889 308 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 RAB39AQ14964 217 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 TMEM240Q5SV17 173 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 RAET1GQ6H3X3 334 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 GALNT13Q8IUC8 556 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 ZNF480Q8WV37 535 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 ARRDC3Q96B67 414 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 TIFAQ96CG3 184 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 ISOC1Q96CN7 298 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 PYURFQ96I23 114 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 OSBPL6Q9BZF3 934 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 CXorf21Q9HAI6 301 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 AASSQ9UDR5 926 aa14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
IRF8-201ENST00000268638 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
IRF8-201ENST00000268638 GABRR3A8MPY1 467 aa14.64□□□□□ -0.07
IRF8-201ENST00000268638 EVPLLA8MZ36 301 aa14.64□□□□□ -0.07
IRF8-201ENST00000268638 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
IRF8-201ENST00000268638 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
IRF8-201ENST00000268638 RPS13P62277 151 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
IRF8-201ENST00000268638 RAE1P78406 368 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
IRF8-201ENST00000268638 ABHD18Q0P651 414 aa14.64□□□□□ -0.07
IRF8-201ENST00000268638 DUOXA1Q1HG43 343 aa14.64□□□□□ -0.07
IRF8-201ENST00000268638 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
IRF8-201ENST00000268638 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa14.64□□□□□ -0.07
IRF8-201ENST00000268638 MAL2Q969L2 176 aa14.64□□□□□ -0.07
IRF8-201ENST00000268638 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
IRF8-201ENST00000268638 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
IRF8-201ENST00000268638 FBXO10Q9UK96 956 aa14.64□□□□□ -0.07
IRF8-201ENST00000268638 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
IRF8-201ENST00000268638 LINC01553A4QN01 128 aa14.64□□□□□ -0.07
IRF8-201ENST00000268638 TRIM64CA6NLI5 447 aa14.64□□□□□ -0.07
IRF8-201ENST00000268638 H0YAE9 185 aa14.64□□□□□ -0.07
IRF8-201ENST00000268638 AGXTP21549 392 aa14.64□□□□□ -0.07
IRF8-201ENST00000268638 GALK1P51570 392 aa14.64□□□□□ -0.07
IRF8-201ENST00000268638 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
IRF8-201ENST00000268638 TMEM26Q6ZUK4 368 aa14.64□□□□□ -0.07
IRF8-201ENST00000268638 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms