RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tstd2Q3U269 495 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tab3Q571K4 716 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prkd1Q62101 918 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Svs6Q64356 99 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tyw1Q8BJM7 721 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Man2a2Q8BRK9 1152 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Abhd1Q9QZC8 412 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Clec2iQ9WVF9 217 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Col11a2Q64739 1736 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam71e2L7N480 754 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ufm1P61961 85 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrrc58Q3UGP9 366 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gtpbp2Q3UJK4 602 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp791Q497V9 528 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mup20Q5FW60 181 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arcn1Q5XJY5 511 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tvp23aQ6NVH0 222 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trmt12Q8BG71 446 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf410Q8BKX7 478 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MylipQ8BM54 445 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smyd4Q8BTK5 799 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ncbp2Q9CQ49 156 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Raver1Q9CW46 748 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q9CXL3 195 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bcl2a1dO55179 172 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gabra3P26049 492 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sox2P48432 319 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ffar3Q3UFD7 319 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Irf4Q64287 450 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dsg4Q7TMD7 1041 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cadm2Q8BLQ9 435 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp446Q8C9M8 523 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr459Q924H8 314 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fars2Q99M01 451 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Efhc1Q9D9T8 648 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr1160A2AVT0 319 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nhsl2B1AXH1 854 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arg2O08691 354 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Syngr1O55100 234 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Syn1O88935 706 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PdgfaP20033 211 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rps13P62301 151 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnal1Q05A62 190 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 DtlQ3TLR7 729 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 B020004J07RikQ3UTC0 476 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm11992Q5SS90 291 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HjurpQ6PG16 667 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 4933430I17RikQ8BHW4 495 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BC024139Q8BVJ3 772 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr701Q9D3U9 316 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Irx5Q9JKQ4 484 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RgrQ9Z2B3 291 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Robo3Q9Z2I4 1366 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wdr76A6PWY4 622 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Il20rbE9Q9A6 308 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr292F8VQ84 308 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp715G3X9T1 886 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r10K7N621 847 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mapk12O08911 367 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Teddm2Q208S0 260 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr681Q3SXH8 315 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PianpQ6P1B3 278 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q8BHR8 331 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Larp4Q8BWW4 719 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tspan8Q8R3G9 235 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr679Q8VGV0 315 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Imp3Q921Y2 184 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Camk2gQ923T9 529 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q99LU8 229 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcbd2Q9CZL5 136 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P33monoxQ9DBN4 303 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Paqr5Q9DCU0 330 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slamf1Q9QUM4 343 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Srp54bE9PXC0 504 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 2610021A01RikE9Q0Q3 834 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r88E9Q235 316 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r52L7N2B2 852 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NapsaO09043 419 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 KeraO35367 351 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ggta1P23336 394 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nudt2P56380 147 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hcrtr1P58307 416 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 H2-Q6P79568 326 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm1604bQ3TRG0 118 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zmat1Q3V0C1 714 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cox8aQ64445 69 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sort1Q6PHU5 825 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr293Q7TS10 336 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cwh43Q91YL7 699 aa12.47□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm43796A0A0J9YV32 372 aa12.46□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Galnt9G3X942 604 aa12.46□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Phkg1P07934 388 aa12.46□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 DtymkP97930 212 aa12.46□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Abraxas2Q3TCJ1 415 aa12.46□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Defb48Q3UW22 87 aa12.46□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hmgcs1Q8JZK9 520 aa12.46□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr170Q8VGL6 313 aa12.46□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam96aQ9DCL2 160 aa12.46□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prl5a1Q9JII2 230 aa12.46□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trgv2A2J008 116 aa12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.2 ms