RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Scamp4Q9JKV5 230 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sirpb1aA0A0A6YYP6 397 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Il17dA0A0B4J1G4 205 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fbrsl1E9Q9T0 1031 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm3488M0QW81 238 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hk2O08528 917 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kpna4O35343 521 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tpst1O70281 370 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cd93O89103 644 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tk1P04184 233 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tuba4aP68368 448 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ap2m1P84091 435 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr616Q3KPB0 317 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kctd21Q3URF8 260 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trim75Q3UWZ0 467 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ppp1r26Q6A025 1163 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Atp11bQ6DFW5 1175 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Adam29Q811Q4 763 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fignl1Q8BPY9 683 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TtpaQ8BWP5 278 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Asrgl1Q8C0M9 326 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Txndc11Q8K2W3 948 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr808Q8VGI8 312 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr352Q8VGJ9 315 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem168Q91VX9 697 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Arpc5lQ9D898 153 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ndufs3Q9DCT2 263 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TescQ9JKL5 214 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc6a14Q9JMA9 638 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gipc2Q9Z2H7 314 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Elf4Q9Z2U4 655 aa9.92□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm35911A0A1D5RLS7 214 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kcna10B2RQA1 511 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccdc62E9PVD1 701 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ccdc149F6V035 524 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nccrp1G3X9C2 266 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ctnnd2O35927 1247 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Adh5P28474 374 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Npy2rP97295 381 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Crisp1Q03401 244 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Syndig1lQ3USQ7 237 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Il15raQ60819 263 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cyp4b1Q64462 511 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rundc3bQ6PDC0 408 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Psmd11Q8BG32 422 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kiaa1671Q8BRV5 308 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bend7Q8BSV3 434 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dnajc27Q8CFP6 273 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vps50Q8CI71 964 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr690Q8VH18 315 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 GlyatQ91XE0 296 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Clcc1Q99LI2 539 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmbim6Q9D2C7 237 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fads3Q9JJE7 449 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Habp4Q9JKS5 411 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PrepQ9QUR6 710 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 B4galt6Q9WVK5 382 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zscan12Q9Z1D7 501 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spin2gA0A0N4SW15 236 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mup6A2AV72 179 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Obox5G3X9P6 291 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spin2eJ3QNQ0 234 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn2r4K7N784 913 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sult2b1O35400 338 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 H2-Q8P14430 326 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TecP24604 630 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Map3k7clP58500 142 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 H2-Q6P79568 326 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gngt2Q61017 69 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ppp2r1bQ7TNP2 601 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1288Q7TQY0 312 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Efr3aQ8BG67 819 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cyp20a1Q8BKE6 462 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tp53bp2Q8CG79 1128 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mcoln3Q8R4F0 553 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr854Q8VFF1 315 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr659Q8VGV6 322 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cxxc5Q91WA4 317 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Atp6v1c2Q99L60 427 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cstf3Q99LI7 717 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pwp1Q99LL5 501 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Msh4Q99MT2 958 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cyp4f15Q99N18 534 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q9CWU4 180 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Atp5dQ9D3D9 168 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Xylt2Q9EPL0 865 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tgm1Q9JLF6 815 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CpqQ9WVJ3 470 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Irs2P81122 1321 aa9.91□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CercamA3KGW5 592 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ifi213D3Z5G0 586 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Xkr6E9Q6C8 638 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc16a8O35308 492 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Angpt2O35608 496 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cyp4a14O35728 507 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bnc1O35914 961 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ugt2b17P17717 530 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Adrb1P34971 466 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dab1P97318 588 aa9.9□□□□□ -0.82
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 NrtnP97463 195 aa9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.9 ms