RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640304.1

RTKN-211, Transcript of rhotekin, humanhuman

TSL 5

Gene RTKN, Length 612 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKN-211ENST00000640304 AP5B1Q2VPB7 878 aa14.64□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 MED27Q6P2C8 311 aa14.64□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 SCIMPQ6UWF3 145 aa14.64□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 HACD2Q6Y1H2 254 aa14.64□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 C11orf74Q86VG3 221 aa14.64□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 C17orf64Q86WR6 236 aa14.64□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 FUNDC1Q8IVP5 155 aa14.64□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 FAM9CQ8IZT9 166 aa14.64□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 KIF2BQ8N4N8 673 aa14.64□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 POU5F2Q8N7G0 328 aa14.64□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 FNDC5Q8NAU1 212 aa14.64□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 CCL4L1Q8NHW4 92 aa14.64□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 HSPA12BQ96MM6 686 aa14.64□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 HBEGFQ99075 208 aa14.64□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 TM9SF3Q9HD45 589 aa14.64□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 SLC52A3Q9NQ40 469 aa14.64□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa14.64□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 POT1Q9NUX5 634 aa14.64□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 SIRT5Q9NXA8 310 aa14.64□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 NDE1Q9NXR1 346 aa14.64□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 TMEM131Q92545 1883 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 CROCCQ5TZA2 2017 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 TLR4O00206 839 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 GYG2O15488 501 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 CSF2P04141 144 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 KRT16P08779 473 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 VARSP26640 1264 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 SLC19A1P41440 591 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 CPA2P48052 419 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 C21orf58P58505 322 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 RPL38P63173 70 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 ABATP80404 500 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 HMGCS1Q01581 520 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 AGKQ53H12 422 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 ICE2Q659A1 982 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 IYDQ6PHW0 289 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 SLC30A9Q6PML9 568 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 SUSD1Q6UWL2 747 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 GK5Q6ZS86 529 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 OR2A1Q8NGT9 310 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 FBXO27Q8NI29 283 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 LRRC61Q9BV99 259 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 SARGQ9BW04 601 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 RHBGQ9H310 441 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 ACTL8Q9H568 366 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 TAAR2Q9P1P5 351 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 TAC3Q9UHF0 121 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 ADGRE2Q9UHX3 823 aa14.63□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 FAM234BA2RU67 622 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 VILLO15195 856 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 GSC2O15499 205 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 CCNDBP1O95273 360 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 FKBP9O95302 570 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 CDH1P12830 882 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 CD1EP15812 388 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 ITGAXP20702 1163 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 HRH2P25021 359 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 CXCR2P25025 360 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 GSTM2P28161 218 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 MAPK1P28482 360 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 NXPH1P58417 271 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 DMWDQ09019 674 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 STX5Q13190 355 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 IMPG1Q17R60 797 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 KIF19Q2TAC6 998 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 CATSPEREQ5SY80 951 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 GALNT18Q6P9A2 607 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 CYP20A1Q6UW02 462 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 RD3Q7Z3Z2 195 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 KRT78Q8N1N4 520 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 AVL9Q8NBF6 648 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 OR9I1Q8NGQ6 314 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 SLC40A1Q9NP59 571 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 DMRT3Q9NQL9 472 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa14.62□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 MAP3K13O43283 966 aa14.61□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 SEMA3DO95025 777 aa14.61□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 PRPS2P11908 318 aa14.61□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 AMD1P17707 334 aa14.61□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 CCR8P51685 355 aa14.61□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 RAP1GDS1P52306 607 aa14.61□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 WDR45BQ5MNZ6 344 aa14.61□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa14.61□□□□□ -0.07
RTKN-211ENST00000640304 IL23RQ5VWK5 629 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.9 ms