RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF398Q8TD17 642 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A23Q9BV35 468 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 NMRAL1Q9HBL8 299 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 FGF21Q9NSA1 209 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 SPTBP11277 2137 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 CREBBPQ92793 2442 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 CACNA1DQ01668 2161 aa23.3■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 H3BMM5 538 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 PKMP14618 531 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 PGDP52209 483 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 PRKAA2P54646 552 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 ITIH4Q14624 930 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM83EQ2M2I3 478 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 ATG16L1Q676U5 607 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 LCN10Q6JVE6 187 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 EFCAB3Q8N7B9 438 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 ULK4Q96C45 1275 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 BIRC8Q96P09 236 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR78Q96P69 363 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 OLFM1Q99784 485 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 ING2Q9H160 280 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 P2RY12Q9H244 342 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC68Q9H2F9 335 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 SYTL2Q9HCH5 934 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 TAS2R13Q9NYV9 303 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 CRYL1Q9Y2S2 319 aa23.29■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 ARGFXA6NJG6 315 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR39O43194 453 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 PRAMEF1O95521 474 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 ACY1Q03154 408 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 ITGA9Q13797 1035 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 NUDCD3Q8IVD9 361 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNJ9Q92806 393 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 ASB8Q9H765 288 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 COPG2Q9UBF2 871 aa23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 F7P08709 466 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 RBP1P09455 135 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 CPA3P15088 417 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 CCL11P51671 97 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 ACAP2Q15057 778 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM69BQ5VUD6 431 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 CYB5D1Q6P9G0 228 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 TAS2R42Q7RTR8 314 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 KMT5CQ86Y97 462 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM151AQ8N4L1 468 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 PPM1MQ96MI6 270 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 PITPNM3Q9BZ71 974 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 GPAMQ9HCL2 828 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 SMOXQ9NWM0 555 aa23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
CAPNS1-216ENST00000628306 OR5K3A6NET4 321 aa23.27■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 TLCD2A6NGC4 264 aa23.27■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 TARM1B6A8C7 271 aa23.27■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 EDF1O60869 148 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 POP7O75817 140 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 SAT1P21673 171 aa23.27■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 GRK2P25098 689 aa23.27■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 CDKN2DP55273 166 aa23.27■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 CHRNA6Q15825 494 aa23.27■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa23.27■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 UGT3A1Q6NUS8 523 aa23.27■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 SERPINA9Q86WD7 417 aa23.27■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 OR6Y1Q8NGX8 325 aa23.27■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 NDNQ99608 321 aa23.27■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 CHST8Q9H2A9 424 aa23.27■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL42Q9P2K6 505 aa23.27■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMD13Q9UNM6 376 aa23.27■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNJ13O60928 360 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 TGDSO95455 350 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 CAPN1P07384 714 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 ACRV1P26436 265 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 HALP42357 657 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 IRF9Q00978 393 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 NFE2L1Q14494 772 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR19Q15760 415 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 KLC3Q6P597 504 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM151BQ6UXP7 276 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 AMZ2Q86W34 360 aa23.26■■□□□ 1.31
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