RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	PLD3	Q8IV08	490 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	BIRC8	Q96P09	236 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	TREX1	Q9NSU2	369 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	SYBU	Q9NX95	663 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	PAK5	Q9P286	719 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	DYTN	A2CJ06	578 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	OR2W5	A6NFC9	320 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	WFS1	O76024	890 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	HEXB	P07686	556 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	PRR35	P0CG20	571 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	CXCR2	P25025	360 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	ARNT	P27540	789 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	EFNA3	P52797	238 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	PER3	P56645	1201 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	MUM1	Q2TAK8	710 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	RNF44	Q7L0R7	432 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	BCORP1	Q8N888	145 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	VPS50	Q96JG6	964 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	PKP4	Q99569	1192 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	TAC3	Q9UHF0	121 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	POLE	Q07864	2286 aa		12.83	□□□□□ -0.35
TCF4-262	ENST00000628078	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	OR2A25	A4D2G3	310 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078		A8MUI8	341 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	KPNA5	O15131	536 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	AVIL	O75366	819 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	MATN4	O95460	622 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	WDPCP	O95876	746 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	ITGAM	P11215	1152 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	MST1	P26927	711 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	NPY2R	P49146	381 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	VPS41	P49754	854 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	KCNJ11	Q14654	390 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	ADCK2	Q7Z695	626 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	MPP5	Q8N3R9	675 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	AMER3	Q8N944	861 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	LPGAT1	Q92604	370 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	SLC30A3	Q99726	388 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	BFAR	Q9NZS9	450 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	COPG2	Q9UBF2	871 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	P2RX6	O15547	441 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	FOXS1	O43638	330 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	UNC5C	O95185	931 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	STS	P08842	583 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	CCNF	P41002	786 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	TNFSF10	P50591	281 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	PMP22	Q01453	160 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	CUL1	Q13616	776 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	PAQR7	Q86WK9	346 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	LRRC6	Q86X45	466 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TCF4-262	ENST00000628078	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		12.82	□□□□□ -0.36

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