RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	LIAS	O43766	372 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	GAS8	O95995	478 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	SERPINA7	P05543	415 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	ITGAM	P11215	1152 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	ERG	P11308	486 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	ARNT	P27540	789 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	FDFT1	P37268	417 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	TTPA	P49638	278 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	PMP22	Q01453	160 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	DSG2	Q14126	1118 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	GBX1	Q14549	363 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	PCOLCE	Q15113	449 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	INA	Q16352	499 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	SYT16	Q17RD7	645 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	MUM1	Q2TAK8	710 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	PEX13	Q92968	403 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM136A	Q96C01	138 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	CABS1	Q96KC9	395 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	PHF12	Q96QT6	1004 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		11.35	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338		E7EVH7	732 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	P2RX6	O15547	441 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	NIPSNAP2	O75323	286 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	UNC5C	O95185	931 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	BMP10	O95393	424 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	WDPCP	O95876	746 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	APRT	P07741	180 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	ERVK-10	P10266	1014 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	FDXR	P22570	491 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	NMBR	P28336	390 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	EMP2	P54851	167 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	ART3	Q13508	389 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	TTC23L	Q6PF05	361 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	PAQR7	Q86WK9	346 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	HAS2	Q92819	552 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	MOCOS	Q96EN8	888 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	HES6	Q96HZ4	224 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	BIRC8	Q96P09	236 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	PANX3	Q96QZ0	392 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	DESI2	Q9BSY9	194 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	GALP	Q9UBC7	116 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
TTLL3-233	ENST00000602338	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	FOXS1	O43638	330 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	MATN4	O95460	622 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	PTMS	P20962	102 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	CMPK1	P30085	196 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC26A3	P40879	764 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	CCNF	P41002	786 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	CA7	P43166	264 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	SNX1	Q13596	522 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF425	Q6IV72	752 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	KIAA1328	Q86T90	577 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM139	Q8IV31	216 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	LPGAT1	Q92604	370 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	MVB12A	Q96EY5	273 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2A5	Q96R48	311 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		11.33	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	11.33	□□□□□ -0.6

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