RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587914.1

EFTUD2-208, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-208	ENST00000587914	TTK	P33981	857 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	CTNNB1	P35222	781 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	MMP12	P39900	470 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	CAPG	P40121	348 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	ALDH3B2	P48448	385 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	PRLHR	P49683	370 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	DGKQ	P52824	942 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	OR4D2	P58180	307 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	ST8SIA6	P61647	398 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	FPGS	Q05932	587 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	ABHD18	Q0P651	414 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	ELP6	Q0PNE2	266 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	MTAP	Q13126	283 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	BIRC2	Q13490	618 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	E2F2	Q14209	437 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	TCEA2	Q15560	299 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	BCL7A	Q4VC05	210 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	SYTL3	Q4VX76	610 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	REC114	Q7Z4M0	266 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	GPR149	Q86SP6	731 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	IFNE	Q86WN2	208 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	MICU2	Q8IYU8	434 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	TERB1	Q8NA31	727 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	TMIE	Q8NEW7	156 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	HERVK_113	Q902F9	699 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	ELMO1	Q92556	727 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	HPS1	Q92902	700 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	GLYATL1	Q969I3	302 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	REPS1	Q96D71	796 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	PPM1M	Q96MI6	270 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	FOPNL	Q96NB1	174 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	OR52E6	Q96RD3	313 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	TRIM4	Q9C037	500 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	USE1	Q9NZ43	259 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	GBF1	Q92538	1859 aa		6.98	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	ENO4	A6NNW6	628 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	TTLL8	A6PVC2	850 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	HIDE1	A8MVS5	230 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914		A8MX80	341 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	TTC34	A8MYJ7	566 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	DLGAP1	O14490	977 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	CLGN	O14967	610 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	EFS	O43281	561 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	BNIP3L	O60238	219 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	DFNA5	O60443	496 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	OBSL1	O75147	1896 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	MYO1D	O94832	1006 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	BPNT1	O95861	308 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	ADH5	P11766	374 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	AMD1	P17707	334 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	ITGB7	P26010	798 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	ASMT	P46597	345 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	DGKG	P49619	791 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	ALDH3A2	P51648	485 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	RPS6KA3	P51812	740 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	MTPN	P58546	118 aa		6.97	□□□□□ -1.29
EFTUD2-208	ENST00000587914	PFN3	P60673	137 aa		6.97	□□□□□ -1.29

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms