RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 ING2Q9H160 280 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 RASSF4Q9H2L5 321 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 DPH5Q9H2P9 285 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 CUTCQ9NTM9 273 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 TAC3Q9UHF0 121 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 ADAM21Q9UKJ8 722 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 MYO18BQ8IUG5 2567 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 NUP210LQ5VU65 1888 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1B0GX78 115 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PPV9 198 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 HYKKA2RU49 373 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 FAM187AA6NFU0 413 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 A6NL46 340 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 H3BMH7 237 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 MYO1CO00159 1063 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 SUV39H1O43463 412 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 CTSVO60911 334 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 SLC16A8O95907 504 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 CAPN1P07384 714 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 NR1D1P20393 614 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 RRADP55042 308 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 YBX1P67809 324 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 CALCOCO2Q13137 446 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 SSPNQ14714 243 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 ICE2Q659A1 982 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 CPZQ66K79 652 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 TCTN3Q6NUS6 607 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 PAQR3Q6TCH7 311 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 KIAA0408Q6ZU52 694 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 ASB18Q6ZVZ8 466 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 MED25Q71SY5 747 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 HDXQ7Z353 690 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 CEP112Q8N8E3 955 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 FBXO36Q8NEA4 188 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 SPATA4Q8NEY3 305 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF480Q8WV37 535 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 COL26A1Q96A83 441 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 PTERQ96BW5 349 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 CABS1Q96KC9 395 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 GBP5Q96PP8 586 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 SLC25A23Q9BV35 468 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM54Q9BYV2 358 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 ZFATQ9P243 1243 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 SLC17A6Q9P2U8 582 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 MED16Q9Y2X0 877 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 TEX264Q9Y6I9 313 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 MAU2Q9Y6X3 613 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 PCM1Q15154 2024 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 RELNP78509 3460 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRM-214ENST00000583153 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 E7ENX8 843 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 GFYI3L273 518 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 K7EM74 188 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 DSCR3O14972 297 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 FANCGO15287 622 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 C8GP07360 202 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 GABRB3P28472 473 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 RPL21P46778 160 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 OR1D4P47884 311 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 PGDP52209 483 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 CDKN2DP55273 166 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 IL2P60568 153 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 ABATP80404 500 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 TAP2Q03519 686 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 KCNC4Q03721 635 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 C2orf54Q08AI8 447 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 MGAT5Q09328 741 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 KLRB1Q12918 225 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 ATP1A4Q13733 1029 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 DSG2Q14126 1118 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 COLEC12Q5KU26 742 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 HECTD2Q5U5R9 776 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 FRMPD2BQ6IN97 320 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 FAM45BPQ6NSW5 357 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 FBXO42Q6P3S6 717 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 CAPN12Q6ZSI9 719 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 OVCH1Q7RTY7 1134 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 STRA8Q7Z7C7 330 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRM-214ENST00000583153 CNTN4Q8IWV2 1026 aa7.96□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms