RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568294.5

HDGFL3-206, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

TSL 4

Gene HDGFL3, Length 3,397 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-206ENST00000568294 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 A0A0C4DFX4 3053 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 MYO16Q9Y6X6 1858 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 ILVBLA1L0T0 632 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 TFECO14948 347 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 TPST2O60704 377 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 TRBC1P01850 177 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 SLC10A3P09131 477 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 INHBBP09529 407 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 GADD45AP24522 165 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 CD70P32970 193 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 FEN1P39748 380 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 ACLYP53396 1101 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 ACSM2AQ08AH3 577 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 CPZQ66K79 652 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 ACSM2BQ68CK6 577 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 NIPAL1Q6NVV3 410 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 NEK5Q6P3R8 708 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 KLHL17Q6TDP4 642 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 C11orf96Q7Z7L8 435 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 GALNT7Q86SF2 657 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 HIPK1Q86Z02 1210 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 STX19Q8N4C7 294 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 OR9Q2Q8NGE9 314 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 NELL1Q92832 810 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 DNASE1L2Q92874 299 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 TADA1Q96BN2 335 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 ZNF347Q96SE7 839 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 COPS4Q9BT78 406 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 ATAD3AQ9NVI7 634 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 RLIMQ9NVW2 624 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 BTBD3Q9Y2F9 522 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 TMEM202A6NGA9 273 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 OR6C75A6NL08 312 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 TTC36A6NLP5 189 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 AIREO43918 545 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 ADAMTS4O75173 837 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 SULT1C4O75897 302 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 SOX14O95416 240 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 STSP08842 583 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 HMGCLP35914 325 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 HNF4AP41235 474 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 RPS26P62854 115 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 MXD1Q05195 221 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 TAB1Q15750 504 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 TTLL9Q3SXZ7 439 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 TMEM53Q6P2H8 277 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 GATAD2AQ86YP4 633 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 C7orf57Q8NEG2 295 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 CHPT1Q8WUD6 406 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 LGALS12Q96DT0 336 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 IL4I1Q96RQ9 567 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 P2RY13Q9BPV8 354 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 APOL4Q9BPW4 351 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 P2RY12Q9H244 342 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 OR51E2Q9H255 320 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 CLMPQ9H6B4 373 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 IMPAD1Q9NX62 359 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 TMEM9Q9P0T7 183 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa8.7□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 MAGEB17A8MXT2 336 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 SSX4O60224 188 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 PCDHGA12O60330 932 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 GALTP07902 379 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 GSTT2P0CG29 244 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 GSTT2BP0CG30 244 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 ACRV1P26436 265 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 LIPAP38571 399 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 UBE3AQ05086 875 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 SMARCB1Q12824 385 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 SYTL3Q4VX76 610 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 ZNF852Q6ZMS4 543 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 SNX20Q7Z614 316 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 OR8H2Q8N162 312 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 FKBP10Q96AY3 582 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 TCF25Q9BQ70 676 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 C11orf16Q9NQ32 467 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 TBCCD1Q9NVR7 557 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 CFAP97Q9P2B7 532 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 OARD1Q9Y530 152 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 VCANP13611 3396 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 E7EQ34 232 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 F11P03951 625 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 HOXC8P31273 242 aa8.69□□□□□ -1.02
HDGFL3-206ENST00000568294 SPAM1P38567 509 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms